Curs 2_clasificarea virusurilor_2021.pptx

virusologie

1. Clasificarea virusurilor Curs 2

2. Deși nu sunt considerate vii, virusurile sunt clasificate de către Comitetul Internațional de Taxonomie a virusurilor (ICTV), în familii , genuri , specii , ( sero )- tipuri sau tulpini virale . În prezent , virusurile sunt încadrate în Phylum - ul Vira , cu: 7 ordine 96 familii 22 subfamilii 420 genuri Sunt cunoscute și descrise aproximativ 2618 specii de virusuri (definite în anul 2012, de ICTV). Denumirile unităților taxonomice se formează după cum urmează : Ordine – cu terminația virales Familii – cu terminația viridae Subfamilii – cu terminația virinae Genuri (virus), specii , ( sero ) tipuri sau tulpini virale . Clasificarea virusurilor

3. Clasificarea acestor agenți infecțioși de tip special, se poate realiza în funcție de mai multe criterii , după cum urmează : 1. După spectrul de gazdă : Virusuri care infectează bacteriile – bacteriofagi Virusuri care infectează fungii – micofagi Virusuri care infectează plantele – virusuri ale plantelor Virusuri care infectează animalele – virusuri ale animalelor 2. După tropism: În funcție de tropismul față de diferite celule gazdă și simptomatologie : virusuri care determină boli generalizate ; v irusuri care infectează organe specifice ( virusuri hepatitice , virusuri respiratorii , virusuri enterice , virusuri dermatotrope , virusuri encefalitice etc. Clasificarea virusurilor

4. Encefalite / meningite : virus JC, pojar , virus LCM, virus rabie Răceli comune : rinovirusuri , virus parainfluenzae , virus respirator sincițial Faringite : adenovirus , citomegalovirus Gingivostomatite : H erpes simplex tip 1 Hepatite : virusuri hepatice tip A, B, C, D, E Infecții ale pielii : virus varicela zoster, herpevirus uman 6, variola , virus papiloma , virusul rubeolei , pojar Infecții oculare : virus herpes simplex, adenovirus, cytomegalovirus Parotidita : virus urlian Pneumonii : virus influenza tip A și B, virus parainfluenza , virus respirator sincițial , adenovirus, coronavirus SARS Mielite : virus polio, HTLV-1 Gastroenterite : adenovirus, rotavirus, norovirus, astrovirus , coronavirus Pancreatite și Afecțiuni cardiovasculare : virus Coxsackie B Boli cu transmitere sexuală : Herpes simplex tip 2, virus papilloma uman , HIV Exemple de i nfecții virale

5. 3. După criterii structurale și de biologie moleculară : După tipul de acid nucleic genomic: virusuri ADN și virusuri ARN ; După conformația capsidei și tipul de simetrie ; După prezența / absența învelișului extern și complexitatea acestuia ; După criterii furnizate de biologia moleculară , aplicabile virusurilor animalelor , bacteriofagilor și virusurilor plantelor . Pornind de la premisa că în centrul ciclului de existență a virusurilor se află etapa de replicare a genomului viral și sinteză a moleculelor de ARNm , există 7 clase de virusuri ( clasificarea Baltimore, 1971). Astfel : Primele 2 clase au genom ADN ( dublu , respectiv monocatenar ); Următoarele 4 clase de virusuri au genom ARN ( 1 clasă cu genom ARN dublu catenar și 3 clase cu genom monocatenar , dar cu polaritate diferită ); Un caracter cu totul deosebit îl au virusurile din clasa a 7-a, numite retrovirusuri . Aceste virusuri prezintă în structura lor o enzimă numită reverstranscriptaza – RT, care catalizează transcrierea inversă a genomului viral de tip ARN, la o moleculă de ADN monocatenară , ce devine ulterior dublu catenară și se integrează în genomul celulei gazdă (cu ajutorul unei enzime , o integrază prezentă în structura virusului ), fiind replicată odată cu acesta (ex. Virusul HIV , Sars CoV-2 ). Clasificarea virusurilor

6. Așadar , clasificarea virusurilor după genomul lor semnifică o încadrare a acestora într -o anumită categorie și se vor comporta la fel , oferind specialiștilor anumite indicații despre cum poate fi abordat studiul lor . Astfe l , în prezent virusurile sunt clasificate în următoarele 7 clase : Clasa I: virusuri cu genom ADN d.c. ( dublu catenar ) ( Adenovirusuri , Herpesvirusuri , Poxvirusuri ); Clasa a II-a: virusuri cu genom ADN m.c . ( monocatenar ) – cu polaritate (+) sau cu “ sens “ ( Parvovirusuri ); Clasa a III-a : virusuri cu genom ARN d.c. ( Reovirusuri , Rotavirus ); Clasa a IV-a: virusuri cu genom ADN m.c . (cu polaritate (+)) ( Hepatitei A, C, enterovirusuri , poliovirusul , rhinovirusuri , v.SARS , v.rubeolei , v.febrei galbene ); Clasa a V-a: virusuri cu genom ADN m.c (cu polaritate (-) sau antisens ) ( v.gripale , v.rujeolei , v.oreionului , v.febrelor hemoragice , v.rabic ); Clasa a VI-a: virusuri cu genom ARN m.c. – RT (cu polaritate (+)) , cu o fază intermediară în ciclul lor de existență în care genomul este transcris invers de RT la o moleculă de ADN m.c ( Retrovirusuri ); Clasa a VII-a: virusuri cu genom ADN d.c – RT ( Hepadnavirusuri - HBV ). Clasificarea după genomul virusurilor

7. Genomul si structura SARS –CoV-2 Virus din familia , Coronaviridae ( CoV-urile ) virus monocatenar cu polaritate pozitiva . Toate virusurile acestei familii sunt extrem de patogene . Secventa genomului SARS-CoV-2 imparte 805 din identitatea secventei cu SARSCoV si 50% cu MERS- CoV . Genomul are 4 cadre de citiredeschise (ORF), dintre care doua treimi codifica 16 proteine nestructurale (nsp-1-16)care alcatuiesc complexul replicazei . Restul de o treime codifica noua proteine accesorii si patru proteine structurale : Proteinele structurale : Glicoproteina S (S- spike) Proteina de invelis E (E) Proteina de membrana M (M) Nucleocapsida N (N)

8. Rol proteina S – mediaza intrarea virusului SARS- CoV in celula gazda . Caracteristici proteina S – un domeniu de legare a receptorilor (RBD) care mediaza contactul direct cu un receptor celular , enzima de conversie a angiotensinei 2 (ACE2) si un sit de scindare polibazica S1/S2 care este scindat proteolitic de ctepsina celulara L si de serina proteazica transmembranara 2 (TMPRSS2). Structura virusului SARS – CoV-2