hipotesis penelitian Kuliah 1 Biokimia.pptx

hipotesis penelitian hipotesis penelitian hipotesis penelitian hipotesis penelitian

1. 29 Jan 2006 Selamat Datang di dunia Biokimia **** Pengantar Biokimia **** “Mengajar tidak bertujuan mengisi botol kosong, tetapi mengajar adalah untuk menyulut api dari suatu obor" – Michel de Montaigne

2. 29 Jan 2006 2 Bahan Acuan Lehninger’s Principles of Biochemistry 4 rd Edition (2004) - by David Nelson & Michael Cox.

3. 29 Jan 2006 3 Tujuan Perkuliahan Memperkenalkan bahasa biokimia: Kosakata (istilah dan struktur), tatabahasa (reaksi-reaksi), struktur kalimat (jalur-jalur metabolisme), dan pengertian (hubungan-hubungan metabolisme) Mengajarkan cara mengambil intisari proses kehidupan Menyarikan kesatuan konsep yang mendasari proses kehidupan Menularkan hasrat mencari tahu atas hal yang akan dipelajari dan hal yang perlu diketahui

4. 29 Jan 2006 4 Cara Belajar Baca bab yang akan dikuliahkan sebelum perkuliahan Belajar 3-5 jam untuk setiap jam perkuliahan Latihan pemecahan masalah Ingat istilah-istilah, struktur, dan jalur-jalur metabolisme Belajar berkelompok

5. 29 Jan 2006 5 Filosofi Pembelajaran Menjelaskan, bukan mengindoktrinasi Menunjukkan hal yang perlu diketahui dan yang tidak perlu diketahui Menghargai pertanyaan tentang hal yang belum diketahui Mempelajari semua hal adalah tidak mungkin, tetapi yang lebih penting adalah mengorganisir hal yang kita ketahui agar dapat digunakan

6. 29 Jan 2006 6 Tentang Struktur Struktur biokimia yang rumit tidak akan pernah dapat ditiru, akan tetapi hal yang perlu dipikirkan tentang struktur tersebut adalah: Bagaimana konsentrasinya berubah sebagai tanggapan atas kondisi metabolisme tertentu Bagaimana struktur tersebut berperan terhadap aktifitas biologisnya Dalam jalur metabolisme mana senyawa dengan struktur tersebut ditemukan (dari apa/mana asal senyawa tersebut dan menjadi apa selanjutnya?)

7. 29 Jan 2006 7 Ciri-Ciri Kehidupan Keragaman biologis: mikroba, ganggang, lumut, tanaman, serangga, burung, monyet, kamu Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik– tidak ada aturan khusus

8. 29 Jan 2006 8 3 Kebutuhan Kehidupan: (1) ENERGI , perlu diketahui bagaimana: Memperolehnya Mengubahnya Menggunakannya Fig. 1-28

9. 29 Jan 2006 9 (2) MOLEKUL S EDERHANA, perlu diketahui bagaimana: Mengubahnya Mempolimerasinya Menghancurkannya

10. 29 Jan 2006 10 (3) MEKANISME KiMIA , untuk: Memperoleh energi Mengendalikan reaksi kimia yang berurutan Mensintesis & mendegradasi makromolekul Mempertahankan kesetimbangan yang dinamis Swa-susun struktur yang kompleks Mengganda secara akurat & efisien Mempertahankan keteraturan proses biokimia dalam lingkungan yang berubah-ubah

11. 29 Jan 2006 11 Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadi Fig. 1-26b

12. 29 Jan 2006 12 Strategi 2: Mahluk hidup menggunakan enzim untuk memacu reaksi yang biasanya lambat

13. 29 Jan 2006 13 Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan termodinamikanya? Fig. 1-11

14. 29 Jan 2006 14 Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan mekanismenya? ? Fig. 1-22

15. 29 Jan 2006 15 Biomolekul - Komposisi 99% dari sel tersusun dari unsur H, O, N, and C Unsur Elektron tanpa pasangan Jumlah relatif H 1 2/3 O 2 1/4 N 3 1/70 C 4 1/10

16. 29 Jan 2006 16 Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung Kehidupan Fig. 1-14 *

17. 29 Jan 2006 17 Isomer Kimia Rumus kimia sama, bentuk berbeda Fig. 1-18a

18. 29 Jan 2006 18 Molekul Khiral bentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan Fig. 1-19a

19. 29 Jan 2006 19 Stereoisomer Rumus dan bentuk kimia sama – fungsi biologis Fig. 1-23a

20. 29 Jan 2006 20 Perubahan Biokimia Dapat Dikelompokkan dalam 5 kategori Reaksi pemindahan gugus Reaksi oksidasi-reduksi Penataan kembali (isomerisasi) Reaksi pemotongan Reaksi kondensasi *

21. 29 Jan 2006 21 Struktur Biomolekul Senyawa penyusun Gula sederhana Asam amino Nukleotida Asam lemak Makromolekul Polisakarida Protein (peptida) RNA atau DNA Lipida Anabolik Katabolik

22. 29 Jan 2006 22 Biosintesis Membutuhkan Molekul Sederhana untuk Digabung secara Kovalen melalui Berbagai Cara … 3eFig. 3-25

23. 29 Jan 2006 23 Kekuatan ikatan kimia tergantung pada 1. K elektronegativan relatif dari dua atom yang berikatan Keelectronegativan tinggi = Afinitas elektron tinggi O 3.5 Cl 3.0 N 3.0 C 2.5 P 2.1 H 2.1 Na 0.9 K 0.8 From 3eTable 3-4

24. 29 Jan 2006 24 2. Jumlah elektron pengikat See Fig. 1-13 *

25. 29 Jan 2006 25 Kekuatan ikatan yang umum Approx. Avg. Triple: 820 kJ/mole Double: 610 kJ/mole Single: 350 kJ/mole

26. 29 Jan 2006 26 Gugus Fungsional yang Umum Fig. 1-15 *

27. 29 Jan 2006 27 Nukleofil Biologis yang Penting: gugus fungsional kaya elektron * 3eTable 3-4

28. 29 Jan 2006 28 Ringkasan… Atom karbon tetrahedral memiliki sifat ikatan yang fleksibel Senyawa-senyawa beratom banyak dapat memiliki beberapa bentuk isomerik Pengubahan bentuk membutuhkan pemutusan ikatan-ikatan kimia Molekul-molekul besar disusun dari molekul- molekul kecil melalui pembentukan ikatan kimia baru

29. 29 Jan 2006 29 Staf Pengajar Drs. Winarto Hariadi, M.Si. Ir. Sedyo Hartono, M.P., Ph.D. Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D.

30. 29 Jan 2006 30 No. Topik Perkuliahan Tanggal Pengajar 1. Pendahuluan Konsep dasar biokimia Reaksi-reaksi biokimia 29-08-2006 Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 2. Air dan Buffer 05-09-2006 Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 3. Karbohidrat I Tinjauan umum Monosakarida Disakarida Polisakarida 12-09-2006 Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. 4. Karbohidrat II Reaksi monosakarida Ikatan glikosida Fungsi karbohidrat 19-09-2006 Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. 5. Asam Amino dan Protein I Tinjauan umum Asam amino Biosintesis asam amino 26-09-2006 Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. 6. Asam Amino dan Protein II Peptida Struktur protein Fungsi asam amino dan protein Biosintesis protein 03-10-2006 Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. 7. UJIAN SISIPAN 10-10-2006 Semua dosen (topik 1 s/d 6)

31. 29 Jan 2006 31 No. Topik Perkuliahan Tanggal Pengajar 7. Lipida I Tinjauan umum Asam lemak jenuh dan tak jenuh Reaksi asam lemak 07-11-2006 Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 8. Lipida II Fungsi asam lemak dan lipida Biosintesis asam lemak 14-11-2006 Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 10. Asam nukleat I Tinjauan umum Nukleosida dan nukleotida 21-11-2006 Ir. Sedyo Hartono, M.P., Ph.D. 11. Asam nukleat II Struktur DNA dan RNA Nukleosida dan nukleotida 28-11-2006 Ir. Sedyo Hartono, M.P., Ph.D. 12. Enzim Tinjauan umum Klasifikasi enzim Koenzim dan kofaktor Mekanisme dan kinetika kerja enzim Penghambatan kerja enzim 05-12-2006 Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 14. Metabolisme I Tinjauan umum Jalur metabolisme 12-12-2006 Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 15. Metabolisme II Bioenergetika Pengendalian metabolisme 19-12-2006 Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 16. UJIAN AKHIR Jadual Fakultas Semua dosen (topik 8 s/d 14)

32. 29 Jan 2006 Tugas Tuliskan 5 hal yang sebelumnya tidak kamu ketahui atau lupa dan dipelajari hari ini