Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0

Support de formation accompagnant un atelier en présentiel de présentation de Mendeley. Public : chercheurs, doctorants, enseignants dans le supérieur

1. ©Club photo et Maxime Storn
Mendeley : gestion de références bibliographiques
et collaboration entre chercheurs
Alain Marois – Bibliothèque de l'Ecole Centrale de Lyon
[email protected] / www.twitter.com/amarois

2. Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Plan
● Les logiciels de gestion de références
bibliographiques
● Installation de Mendeley
● Gérer sa bibliothèque de références
● Citer en utilisant ses références
● Partager, collaborer, gérer son identité numérique

3. Trop de références bibliographiques
Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
sur une idée originale de Valentin Vivier

4. Gérer sa bibliographie
● S'organiser
● Capitaliser
● Privilégier le fond sur la forme
● Partager des références, collaborer
● Découvrir de nouveaux travaux ?
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5. Des outils dédiés
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6. Besoins classiques...et émergents
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sur une idée originale de Martin Fenner

7. Mendeley 1/2
● Logiciel à installer + service en ligne
(http://www.mendeley.com)
● Windows + Mac + Linux
● Modèle de Last.fm (partage de musique)
● Version beta, gratuit, mais...
●...business model en évolution, mais...
●... « what is free now will remain free »
● Société basée à Londres
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8. Mendeley 2/2
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9. Installation de Mendeley
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10. Téléchargement : option 1
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Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte

11. Téléchargement : option 2
Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori
Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes
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12. Installation : les plugins Word et OpenOffice
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Compatibilité word 2003 - 2007
Compatibilité OpenOffice

13. Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
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Collections, collections
partagées, corbeille
Filtres (auteurs, journaux,
tag, mots clés auteur
Liste des références
Détails, tag et annotations,
références citées
Moteur de recherche Barre d'outils

14. Créer sa bibliothèque de références
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15. Ajouter des références : via Mendeley Desktop
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Différentes stratégies :
● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents
● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF
● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.
Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...
...et Mendeley extraira les descriptions du document
PDF automatiquement

16. Ajouter des références : utiliser l'import web
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Un simple lien placé dans la barre d'adresse
permet d'importer directement des résultats
de recherche à partir des sites compatibles
Choisir les références dans la fenêtre
dédiée, annoter, ajouter des tag
1
2

17. Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...
Import web : installation et compatibilité
Les principales sources d'information scientifique
http://www.mendeley.com/import

18. Synchronisation de sa bibliothèque de références
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Synchronisez votre bibliothèque Mendeley
Dekstop avec votre compte en ligne
Gestion et édition en ligne de vos références

19. Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
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Indiquez le dossier à importer contenant les
PDF
L'importation se déroule automatiquement et les références
correspondant aux documents PDF apparaissent
Mendeley va chercher les informations décrivant
les documents dans les bases de données
d'information scientifique
1
3
2

20. Si vous venez de EndNote
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1
Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)
Sélectionner les références à exporter
2 Dans Mendeley, choisir le format d'import
RIS ou EndNote Xml suivant le format
d'export EndNote
De la même manière, Mendeley peut
importer des listes de références aux
formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...

21. Gérer sa bibliothèque de références
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22. Des fonctions de gestion simples et utiles
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Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture
Les références peuvent être marquées
comme « à lire », « lues », « favorites »
Créez vos propres collections
Filtrez vos listes de références de façon aisée
Triez rapidement vos listes en
cliquant sur les en-têtes de colonne
Collection créées par défaut :
●Toutes les références
●Ajouts récents
●Mes favoris
●Références à vérifier
●Mes publications
●Publications non classées

23. Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
Formation Mendeley
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Mise à jour de la liste de
résultat au cour de la frappe
Recherche dans les références et
les PDF de toutes les collections
Mise en contexte et surlignage
des termes recherchés
Suggestion de termes au
court de la frappe

24. Utilisation avancée du moteur de recherche
Formation Mendeley
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champs:terme à recherche
Exemples :
● author:harnad
● keyword:Bacteria
● publication:nature
● tag:tools
● title:« open access »

25. PDF : lecteur intégré + et recherche de mots-clés
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Surlignage du terme recherché dans le PDF
Outils d'exploitation avancée : notes,
surlignage manuel, lecture plein écran, etc.
Ouverture des PDF
dans des onglet dédiés

26. PDF : surlignez et annotez vos documents
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Annotation (avec auteur et date)
Notes générales
Passage surligné manuellement
Listes des annotations avec leurs
liens pour une navigation aisée

27. Classez et renommez automatiquement vos fichiers
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L'outil de gestion des fichiers et ses options
Classement et nommage paramétrables
Tools > Option > File Organizer

28. PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes
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Fichiers organisés automatiquement en arborescence
PDF (et autres fichiers) joints renommés

29. Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation
des noms de journaux, auteurs, tag, etc.
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Passage surligné manuellement
Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les
unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs
Mendeley modifie automatiquement
les références en conséquence
1
2

30. Citer en utilisant ses références
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31. Citer dans Word et OpenOffice 1/2
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Placer son curseur à l'emplacement de
l'appel de citation dans votre texte
Cliquer sur « Insert Citation dans la
barre d'outil Mendeley de Word
Dans Mendeley, choisir la référence à citer
1
2
3

32. Citer dans Word et OpenOffice 2/2
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L'appel de citation est intégré au format
choisi à l'emplacement du curseur
Cliquer sur « Send Citation to Word »
4
5

33. Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
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Finaliser son texte avec
tous les appels de citation
Positionner son curseur à l'endroit
où doit figurer la bibliographie
Cliquer sur « insert Bibliography »
Choisir un style bibliographique
La bibliographie est générée automatiquement
Vous pouvez changer le style :
le document se met à jour
1
2
3

34. Produire une simple liste de références formatées
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Sélectionnez des références
Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)
La liste est au format sélectionné
Cela fonctionne aussi par copier-coller

35. Un vaste choix de styles bibliographiques
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Ooo : « Choose Citation Style »
Word : « Other citations from Mendeley »
Recherchez et sélectionnez un style

36. Utiliser LaTeX / BibTeX : options de
synchronisation de la bibliothèque de références
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Tools > Options > BibTeX
Prise en compte de caractères spéciaux
Mise à jour automatique du fichier .bib
Un ou plusieurs fichiers. On peut
imaginer le mettre sur un dossier
partagé... Clés BibTeX éditables si besoin
référence par référence

37. Partager, collaborer, s'intégrer à une communauté
en gérant son identité numérique
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38. Rendre une collection publique
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Les critères de publication des collections sont paramétrables
pour chacune d'entre elles indépendamment des autres
Rendez vos collections
publiques via « Edit Settings »
D'autres usagers pourront s'abonner
à vos collections publiques. Vos
modifications seront répercutées
dans les Mendeley Desktop des
autres membres abonnées. Les
membres abonnées à une collection
sont visibles, ainsi que l'auteur d'une
collection

39. Créer une collection partagée pour collaborer
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Une collection partagée entre membres n'est
visible uniquement que par ses membres.
Vous pouvez inviter vos contacts à partager
une collection que vous avez créée.
Les références sont alors visibles et
modifiables par tous les membres partageant
la collection.
Les fichiers PDF peuvent être mis en commun
et annotés collaborativement.

40. Compléter son profil et sa liste de publications :
l'identité numérique du chercheur
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CV du chercheur
Liste des publications du
chercheur, mise à jour via une
collection Mendeley
Contacts du chercheur
Collections publiques
du chercheur
Contacter ce chercheur
Statistiques sur ce
chercheur

41. Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?
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“
”
We define social network sites as web-
based services that allow individuals to
(1) construct a public or semi-public
profile within a bounded system, (2)
articulate a list of other users with
whom they share a connection, and (3)
view and traverse their list of
connections and those made by others
within the system.
Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship.
Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from
world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.

“
”

42. Paramétrer la confidentialité de son profil
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Plusieurs niveaux de confidentialité
Se tenir informé

43. Valoriser son travail bibliographique et son expertise
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Inclure un bouton vers son profil
dans votre signature de courriel
ou sur son blog de chercheur
Créer par simple copier-coller
une liste de publication mise à
jour automatiquement

44. Trouver de l'aide
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley

45. Mendeley : participer, suivre l'évolution
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley
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46. >
Statistiques et sérendipité
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley
Données globales
Données par disciplines
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47. Questions ?
Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Alain Marois
04.72.18.64.50
[email protected]

48. Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Ressources
● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur
le world wide web :
<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.
●Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS
Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>
● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>
● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>
● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].
Disponible sur le world wide web :
<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>
● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-
328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008