8 Indice de seleccion (II)

1. Genética de Poblaciones
Cátedra de Genética y Mejoramiento Animal
• Indices de Selección con más de una fuente de
información
• Efectos Ambientales
• Metodo BLUP

2. METODO QUE UTILIZA:
Varianza, Parentesco, Covariancia
entre parientes y Heredabilidad
INFORMACION
(fenotipos)
DEL ANIMAL
y/o SUS
PARIENTES
Indice de Selección (IS) VCE
VALOR DE
CRIA
ESTIMADO
P
1
= G
1
+ E
1
VCE
1
P
2
= G
2
+ E
2
VCE
2
P
3
= G
3
+ E
3
VCE
3
P
N
= G
N
+ E
N
VCE
N
… …

3. METODO
Índice de Selección (IS)
Función Lineal de las observaciones
nn2211
.Xb.Xb.XbIS +++= ...
Donde:
b
i
(i=1, …, n) son factores de ponderación de cada observación fenotipica
X
i
(i=1, …, n) observaciones fenotipicas consideradas para el IS de un animal
candidato a ser seleccionado (α)
å
=
==
n
1i
ii.XbVCEIS

4. 332211
.Xb.Xb.XbIS
++=
a
Información propia
Información madre
Inf. Progenie

5. 321α
0.110.X0.110.X0.267.XIS
++=
De dónde se
obtienen los factores
de ponderación (b
i) ?
Como el IS puede incorporar distintas
fuentes de información para un carácter o
caracteres, se deberán estimar varios
factores de ponderación, obtenidos por
resolución de ecuaciones.

6. ETyMnénOeteátiyt
áanéDyMédrteáitQU Exactitud de la
estimación del VC
es la correlación entre el Valor de Cría Estimado (VCE) correlación entre el Valor de Cría Estimado (VCE) obtenido
por medio del Índice de Selección (IS) y el Valor de Cría verdadero (Ga)y el Valor de Cría verdadero (Ga), que
es desconocido y no lo podemos observar.
i1αGa VCE
.bar =
iiα
n
1i
Ga VCE .bar å
=
=

7. Modelo Genético
iii
EGP ±=
Fenotipo = Genotipo + Ambiente
Analizaremos con más detalle el efecto del ambienten e ati atcyMn jáatr tPársnéM atvOátérciOLárt
ártiytjáaoOáanyteátiytáTojáaédrteáti atPáráateáti at
éreéZéeO at
todos los factores no genéticos que influyen
en la respuesta de la expresión de los genes de los
individuos

8. ii
XμP +=
iii
Xμ)E(G +=+
iii
Xμ-)E(G =+

9. ii
XμP +=
iii
Xμ)E(G +=+
iii
Xμ-)E(G =+
P
22
= 8500 kg
si µ = 7500 kg
X
22
= 1000 kgaOo rátvOátp
é
táan,tiéGját
eátácáMn atyDGéárnyiáat
aéanáD,néM atLtvOátáit
ácáMn teáityDGéárnát
ycáMnyto jtéPOyitytn e at
i atcár néo ateátiyt
o GiyMédr
supone que X
i
está libre
de efectos ambientales
sistemáticos y que el
efecto del ambiente
afecta por igual a todos
los fenotipos de la
población

10. Lactancia = P
i

11. Efectos ambientales: ganado lechero
Edad Época y año de parto
Días de seca
Días abierta
Días de lactancia
Manejo del tamboLactancia = P
i
Lactancia = P
i
Otros efectos

12. producción de leche según número de lactancia
El número de parto afecta la producción de leche. Las vacas de 3 a 5
partos producen más leche que vacas muy jóvenes o muy viejas
Fuente: Base de datos FCV-ACHA Febrero 2012

13. producción de leche según mes de parto
Los meses de parto de otoño-invierno tienen
lactancias de mayor producción de leche que los de
primavera-verano
Fuente: Base de datos FCV-ACHA Febrero 2012

14. producción de leche según año de parto
Fuente: Base de datos FCV-ACHA Febrero 2012
El clima y las condiciones del mercado determinan
condiciones distintas de producción cada año
5500
6000
6500
7000
7500
8000
8500
k
g

d
e

l
e
c
h
e
-
3
0
5
d
969798990001020304050607080910
Año de parto
kg de leche

15. Ambiente
• No toda superioridad o inferioridad en la medición de
los animales es por causas genéticas

• El medio ambiente afecta los niveles de producción de
las características que medimos y queremos mejorar

• Estos efectos nos pueden inducir a seleccionar erróneamente

• Es necesario tenerlos en cuenta para estimar los Valores de Cría
sin errores

16. Ambiente
• No toda superioridad o inferioridad en la medición de
los animales es por causas genéticas

• El medio ambiente afecta los niveles de producción de
las características que medimos y queremos mejorar

• Estos efectos nos pueden inducir a seleccionar erróneamente

• Es necesario tenerlos en cuenta para estimar los Valores de Cría
sin errores

17. Efectos Ambientales
AjustablesAjustables GrupalesGrupales

18. Efectos Ambientales
AjustablesAjustables
•Ocurren sistemáticamente, su
efecto es predecible.
•Son cuantificables.
•Están presentes en todos los
rodeos y todos los años.
•Afectan a cada individuo y
conocemos el nivel del efecto.

19. Efectos Ambientales
AjustablesAjustables
•Ocurren sistemáticamente, su
efecto es predecible.
•Son cuantificables.
•Están presentes en todos los
rodeos y todos los años.
•Afectan a cada individuo y
conocemos el nivel del efecto.
Funciones matemáticas
Ajuste de la producción de leche según el
número de la lactancia

20. Efectos Ambientales
AjustablesAjustables
•Ocurren sistemáticamente, su
efecto es predecible.
•Son cuantificables.
•Están presentes en todos los
rodeos y todos los años.
•Afectan a cada individuo y
conocemos el nivel del efecto.
Multiplicativos
Ajuste de la producción de leche según el
número de la lactancia

21. Efectos Ambientales
AjustablesAjustables
•Ocurren sistemáticamente, su
efecto es predecible.
•Son cuantificables.
•Están presentes en todos los
rodeos y todos los años.
•Afectan a cada individuo y
conocemos el nivel del efecto.
Aditivos
Ajuste de PN y PD según edad de la madre
(A.Angus)

22. Efectos Ambientales
GrupalesGrupales
•efectos ambientales que
afectan a grupos de
animales que se encuentran
bajo condiciones
irrepetibles, únicas para ese
grupo de individuos
•NO son ajustables

23. Efectos Ambientales
GrupalesGrupales
•efectos ambientales que
afectan a grupos de
animales que se encuentran
bajo condiciones
irrepetibles, únicas para ese
grupo de individuos
•NO son ajustables

24. El índice de selección es un poderoso método para la evaluación
genética.
Sin embargo un supuesto básico del índice de selección es que la
información de performance utilizada proviene de grupos
contemporáneos (mismo año y mismo establecimiento)

25. BLUP
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
Metodología estadística que permite resolver los problemas planteados por los
efectos ambientales, comparar distintas generaciones entre sí a lo largo del tiempo y
comparar establecimientos ganaderos que se encuentran en distintas zonas
geográficas.

26. BLUP
•El nombre proviene de sus propiedades estadísticas
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
•Tiene las mismas propiedades que el Indice de Selección,
permitiendo además incluír efectos ambientales.
•Utiliza toda la información disponible del animal y de sus
parientes basado en el coeficiente de parentesco (matriz
de parentesco = método tabular)

27. BLUP
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
•Utiliza toda la información disponible del animal y de sus
parientes basado en el coeficiente de parentesco (matriz
de parentesco = método tabular)

28. BLUP
•El nombre proviene de sus propiedades estadísticas
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
•Tiene las mismas propiedades que el Indice de Selección,
permitiendo además incluír efectos ambientales.
•Utiliza toda la información disponible del animal y de sus
parientes basado en el coeficiente de parentesco (matriz
de parentesco = método tabular)
•Utiliza un modelo lineal para representar los fenotipos
medidos u observados en la población

29. BLUP
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
•Utiliza un modelo lineal para representar los fenotipos
medidos u observados en la población

30. BLUP
Best Linear Unbiased Predicition
Mejor Predicción Linear Insesgada
•BLUP modelo animal
todos los animales de una población se evalúan
simultáneamente, incluso los que no tienen datos aún
•BLUP multicarácter
evaluación simultánea de varios caracteres
incluyendo las correlaciones genéticas entre
ellas (ejemplo : Peso al Nacer, Peso al Destete,
Peso Final)

31. Es la sumatoria de los efectos medios de todos los genes que posee un individuo, Es la sumatoria de los efectos medios de todos los genes que posee un individuo,
teniendo en cuenta ambos alelos en cada loci y considerando todos los loci que codifican teniendo en cuenta ambos alelos en cada loci y considerando todos los loci que codifican
para una característica determinadapara una característica determinada
En la práctica:
Es el doble de las desviaciones promedio de su progenie con respecto a la media de
la población, siempre y cuando dicho individuo haya sido apareado con una muestra
al azar de la población.
-Es expresado como desvío de la media de la poblacion
VC = 2 (Media hijos – Media poblacional)
VCE = 2 (Diferencia Esperada de la Progenie)

32. VCE = 2 (Diferencia Esperada de la Progenie)
la mayoría de las evaluaciones genéticas se
publican como DEPs
2
VCE
DEP=

38. B1- Para una población de ganado lecheros se determinó : h
2
= 0.25 y

En un centro de IA los toros serán seleccionados en base a X
1
= promedio de 300 medio hermanas
paternas y X
2
= promedio de 50 hijas.
b
1
= 0.427 b
2
= 1.103
a)Plantee el IS
b)Calcule las covariancias y variancias necesarias para las ecuaciones del IS
c)Calcule la exactitud de este IS.
d)Compare el peso relativo de b
1
y b
2
. Cuál es la fuente de información más importante?
toro X
1
X
2
IS exactitud ranking
A +1000 -10
B +80 +850
C 0 +80
D +50 +600
E +300 +7
22
X
kg 1600000σ=

39. a
ij
. h
2
. σ
2
p
Calculo de covariancias entre parientes
σ
σ
2
P
2
Ga2
h=
Cov (X
i
,G
α
) = a
iα
. h
2
. σ
2
p
Cov (X
i
,X
j
) =
ú
û
ù
ê
ë
é+
=
p
.a1).h-(p 1
.σσ
ii´
2
2
P
2
X

40. B1- Para una población de ganado lecheros se determinó : h
2
= 0.25 y

En un centro de IA los toros serán seleccionados en base a X
1
= promedio de 300 medio hermanas
paternas y X
2
= promedio de 50 hijas.
b
1
= 0.427 b
2
= 1.103
a)Plantee el IS
b)Calcule las covariancias y variancias necesarias para las ecuaciones del IS
c)Calcule la exactitud de este IS.
d)Compare el peso relativo de b
1
y b
2
. Cuál es la fuente de información más importante?
toro X
1
X
2
IS exactitud ranking
A +1000 -10 415,97 0,81
3
B +80 +850 971,71 0,81
1
C 0 +80 88,24 0,81
5
D +50 +600 683,15 0,81
2
E +300 +7 135,821 0,81
4
22
X
kg 1600000σ=

41. B2.- Suponga que se evalúan individuos en base a dos IS, para cuatro características de distinta h
2

I. IS = b
1
. X
1
+ b
2
. X
2
+ b
3
. X
3
II. IS = b
1
. X
1

Donde : X
1
= información propia X
2
y X
3
= información de cada progenitor
a)Calcule la exactitud para ambos IS y cada h
2
b)Grafique la relación b2 / b1 en función de la h2 para el primer IS.
c)Grafique la relación exactitud I / exactitud II , en función de la h2.
d)Basado en los gráficos anteriores, que puede concluir sobre el aporte de información propia y de los progenitores
en este IS?
IS
I
h2
0.10 0.30 0.50 0.70
b
1
0.096 0.267 0.429 0.603
b
2
0.045 0.110 0.143 0.139
b
3
0.045 0.110 0.143 0.139
exactitud
IS
II
h2
0.10 0.30 0.50 0.70
b
1
0.10 0.30 0.50 0.70
exactitud

42. B2.- Suponga que se evalúan individuos en base a dos IS, para cuatro características de distinta h
2

I. IS = b
1
. X
1
+ b
2
. X
2
+ b
3
. X
3
II. IS = b
1
. X
1

Donde : X
1
= información propia X
2
y X
3
= información de cada progenitor
a)Calcule la exactitud para ambos IS y cada h
2
b)Grafique la relación b2 / b1 en función de la h2 para el primer IS.
c)Grafique la relación exactitud I / exactitud II , en función de la h2.
d)Basado en los gráficos anteriores, que puede concluir sobre el aporte de información propia y de los progenitores
en este IS?
IS
I
h2
0.10 0.30 0.50 0.70
b
1
0.096 0.267 0.429 0.603
b
2
0.045 0.110 0.143 0.139
b
3
0.045 0.110 0.143 0.139
exactitud
0,38 0,61 0,76 0,86
b2/b1
0,47 0,41 0,33 0,23
IS
II
h2
0.10 0.30 0.50 0.70
b
1
0.10 0.30 0.50 0.70
exactitud 0,32 0,55 0,71 0,84

43. B3.- Plantee el IS necesario para evaluar toros Angus para el rasgo peso al destete y calcule
su exactitud.
X
1
= registro propio
X
2
= registro del padre
X
3
= promedio de 10 medio hermanos paternos
X
4
= registro de la madre
b
1
=0.25
b
2
= 0.12
b
3
= 0.33
b
4
= 0.12

44. B4.- Calcule la lactancia ajustada por le número de parto de las siguientes vacas Holando Argentino,
utilizando factores de ajuste multiplicativos. Cual es número de parto al cual se ajustan las lactancias ?

vaca Nro. De partoproducción controladaproducción ajustada
A 1 6.000 kg
B 3 13.000
C 6 10.000
D 9 7.500

45. B5.- Calcule el peso de los siguientes terneros Angus considerando la edad de la madre para peso al nacer y peso al destete.
Fuente : Asociación Angus Argentina

ternero PN PD edad madre
A 35 250 2 años
B 42 300 8
C 40 295 4
D 39 310 10

46. B6.- Analice la información del toro Angus adjunta, correspondiente al catálogo de un centro de IA y
haga una lista de los caracteres evaluados, su correspondiente DEP y Precisión