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Cours Cours Cours Cours dededede bact bact bact bact éééériologie riologie riologie riologie mmmméééédicale dicale dicale dicale
COCCI COCCI COCCI COCCI GRAM GRAM GRAM GRAM POSITIF POSITIF POSITIF POSITIF
....Genre Genre Genre Genre staphylocoques staphylocoques staphylocoques staphylocoques
....Genre Genre Genre Genre streptocoques streptocoques streptocoques streptocoques
1.1.1.1.GENRE: GENRE: GENRE: GENRE: STAPHYLOCOQUES STAPHYLOCOQUES STAPHYLOCOQUES STAPHYLOCOQUES
Caract Caract Caract Caract ééééristiques ristiques ristiques ristiques :
•Gram positif non sporul éecellules immobiles, sph ériques, généralement dispos ées
en grappes .
•Cocci simple, en paires, tétrades etles cha înes sont visibles dans les Cultures
liquide
•lacoloration des Jeunes coques fortement Gram-positifs, de nombreux vieilles
cellules deviennent des gram-n égatif
•Les trois principales esp èces d'importance clinique
.Staphylococcus aureus
.Staphylococcus epidermidis
.Staphylococcus saprophyticus
•Esp èces de staphylocoques moins courantes
.Staphylococcus lugdenensis
.Staphylococcus hominis
.Staphylococcus warneri
•Peut facilement cro ître dans des milieux ordinaires dans des conditions aérobies et
micro aérophiles
•lacroissance plus rapide à37 °C, mais forme mieux de pigment àune temp érature
de 20-25 oc
•Colonies sur les milieux solides sont ronds, lisses, élev ées etluisants.
•Certains d'entre eux sont de laflore normale de lapeau etdu mucus membrane de
l'homme, d'autres causent suppuration abc èsformation etlaseptic émie fatale
•Produirent lacatalase, qui les diff érencient des streptocoques.
•Relativement résistant àladessiccation, lachaleur, et9% de Na Cl, mais facilement
Inhib éepar 3% hexachloroph ène
Staphylocoques Staphylocoques Staphylocoques Staphylocoques
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Structure Structure Structure Structure antig antig antig antig éééénique: nique: nique: nique:
1. Péptidoglycane (mucopeptide): polym ère polysaccharidique qui fourni
l'exosquelette rigide de laparoi cellulaire. Ilest important dans lapathogen èse de
l'infection comme provoquant laproduction de cytokines etdes anticorps opsoniques;
chimio-attr actif pour les polymorphes, etactiver lecompl ément
2. Acide teicho ïques :Polym ère de glyc érol ou phosphate ribitol.
3. Prot éine A: Important dans letest de diagnostic immunologique (test de agglutination).
4. Capsule:. Propri étéanti-phagocytaire
5. Enzymes
.Catalase Produit par staphylocoques Convertit H202 en H20 etoxyg ène (O2)
Le test de lacatalase diff érencie les staphylocoques (catalase positive) des
streptocoques (catalase négative)
.Coagulase etlefacteur de l’agglutination
.Caillots Coagulase oxyd ésou plasma citrat é.Coagulase peut déposer lafibrine sur
lasurface de l’organisme, etde modifier l’ingestion par les cellules phagocytaires.
.Facteur d’agglutination :Compos éde surface qui est responsable de l'adh érence de
L’organisme de fibrinog ène etde lafibrine
Produit par Staphylocoques aureus
Détermine potentiel invasif de l’organisme.
Test de Coagulase diff érencie S.aureus (Coagulase positive) de S.epidermis (Coagulase
négative )
.Facteur de hyaluronidase -Diffusion
.Prot éases etles lipases
.Staphylokinase -Fibrinolysine
.β-lactamase -Fournit larésistance de staphylocoque àβ-lactamines comme la
pénicilline .
.Dnase :Désoxyribonucl éique
.nucl éase
6.Toxines
.Exotoxines (α,β,γ,δ)
.Ent érotoxine produite par S. aureus, lorsqu'elle est cultiv éeen glucides eten
prot éines des aliments .
Multiple (A-E ,G-I, K-M )soluble ,enzyme intestinal thermostable toxines
résistantes qui agissent sur les récepteurs neuronaux dans l'intestin pour stimuler le
centre du vomissement dans lesyst ème nerveux central. Ilest super- antig ène
d'origine alimentaire staphylococcique empoisonnement
.Choc toxique toxine du syndrome superantigene desquamatif toxine produite par S.
aureus etprovoque de lafièvre, choc, défaillance multi organe etune éruption
cutan ée.
.Exfoliative super antig énique toxine produite par S. aureus épidermolytique et
utilise desquamation généralis éede lapeau (Syndrome de lapeau ébouillant ée
staphylococcique) .
Epidermolytique toxine A:produit du gène chromosomique etstable àlachaleur
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Epidermolytique toxine B:Plamid médiation etthermolabile
.Leucocidine :Saureus toxine qui tue les globules blancs en formant des pores et
augmente laperm éabilit éde cation
Signes Signes Signes Signes cliniques cliniques cliniques cliniques ::::
.Folliculite :Infection d'un follicule pileux.
.Furoncle :infection des follicules pileux multiples etlapeau environnante .
.Cellulite :infection de lapeau etdu tissu sous-cutan é.
.La formation d'abc ès:suppuration focal
.Mammite :infection de lapoitrine, en particulier chez lamère allaitante
.Imp étigo bulleux :lésion superficielle de lapeau en cro ûte
.Pneumonie: Infection du parenchyme pulmonaire.
.Empy ème :accumulation de pus dans l'espace pleural
.Ost éomy élite :infection de l'os
.Endocardite etlaméningite :infection du tissu cardiaque etleptom éninge
respectivement .
.Intoxication alimentaire :Caus éepar une ent érotoxine produite par S. Aureus
.Caract éris épar de violentes naus ées ,des vomissements etde ladiarrh ée
.Syndrome de choc toxique :Caus éepar syndrome de choc toxique toxine -1
produite par S. aureus
.Caract éris éepar l'apparition brutale d'une forte fièvre ,des vomissements ,de la
diarrh ée,myalgie ,scarlatiform éruption ,etune hypotension avec cardiaque et
insuffisance rénale dans lamaladie laplus grave
.Se produit en 5jours apr èsledébut des menstruations chez les jeunes femmes qui
utilisent tampons
.Syndrome staphylococcique de lapeau :caus éspar latoxine produite par S. aureus
exfoliative .
S. saprophyticus :lacause relativement commun infections des voies urinaires chez
les jeunes femmes
S. epidermidis :cause occasionnelle de l'infection souvent associ éeavec des appareils
etdes dispositifs implant és.
Diagnostic du laboratoire :
L'échantillon ou leprélèvement :Tampons de surface ,du pus ,lesang ,lecrachat ,
leliquide céphalo-rachidien
Frottis :cocci àGram positif en grappes ,seuls ou en couples .
Culture :Cultive bien en aérobie eten CO2 sur milieu ordinaire enrichi àune
temp érature optimale de 35 °c-37 °c.
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Aspect Aspect Aspect Aspect dededede lalalalacolonie colonie colonie colonie ::::
S. aureus :colonies de caract éristique d'or ée.
Souvent non pigment éeapr èspendant une nuit d’incubation.
Hémolytique sur gélose au sang .
Le milieu contenant 7,5% de NaCl est utilis épour une flore mixte de prélèvement
contamin é.
Slt agar Mannitol est utilis épour ledépistage de porteurs nasaux de S. aureus
S. epidermis: colonies blanches, non hémolytique
S. saprophyticus: peut être blanc ou jaune, non hémolytique.
RRRRééééaction action action action biochimique biochimique biochimique biochimique
1.1.1.1.leleleletest test test test catalase catalase catalase catalase
Bouillonnement actif ................ bact éries productrices du Catalase (Staphylocoque )
Pas de bouillonnement actif ..... bact éries no productrices du catalase (streptocoques)
2.2.2.2.Test Test Test Test dededede coagulase coagulase coagulase coagulase
a.a.a.a.Test Test Test Test sursursursur lame lame lame lame :Pour détecter lacoagulase
Agglutination en 10 secondes .................................. S.aureus
Aucune agglutination en 10 secondes ..................... (staphylocoques coagulase négative)
b.b.b.b. Test Test Test Test enenenen Tube: Tube: Tube: Tube: Pour détecter lacoagulase libre
Caillot de fibrine ....................... S. aureus
Pas de caillot de fibrine ............ (Staphylocoques coagulase négative)
Tests Tests Tests Tests dededede sensibilit sensibilit sensibilit sensibilit éééé::::
Novobiocine sensible .......... S. aureus etS. epidermis
Novobiocine résistant ......... S.saprophyticus
Diff Diff Diff Diff éééérenciation renciation renciation renciation desdesdesdes espespespesp èèèècescescesces
Traitement Traitement Traitement Traitement
Staphylocoques sensibles àlapénicilline ......... pénicilline, l'ampicilline
Staphylocoques résistants àlapénicilline ......... cloxacilline, Nafcillin
Méthicilline staphylococcie résistant ............. ..vancomycine
PrPrPrPr éééévention vention vention vention etetetetcontr contr contr contr ôôôôlelelele
Source de l'infection est l'excr étion de lésions humaines, voies respiratoires etlapeau
Contacter propagation de l'infection se produit dans les hôpitaux
Traitement des porteurs nasaux avec des antiseptiques topiques ou larifampicine et
anti-staphylococcique
Organisme Organisme Organisme Organisme Colonie Colonie Colonie Colonie catalase catalase catalase catalase coagulase coagulase coagulase coagulase Novobiocine Novobiocine Novobiocine Novobiocine HHHHéééémolyse molyse molyse molyse
S. aureus d'or ée Positive Positive Sensible positive
S. epidermidis blanc gris Positive Négatif Sensible Négatif
S. Blanc blanc gris Positif Négatif Résistant Négatif
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2.2.2.2.GENRE: GENRE: GENRE: GENRE: STREPTOCOQUES STREPTOCOQUES STREPTOCOQUES STREPTOCOQUES
Caract éristiques:
•Ils sont immobiles, non sporul és,ana érobies facultatives àGram positif
•Cellules sph ériques ou ovales formant de paires ou des cha înes pendant lacroissance
•Pousse bien sur des milieux solides ordinaires enrichis avec du sang ,de sérum ou de
glucose .
•La plupart des streptocoques poussent dans des milieux solides en colonies disco ïdes
•Souches capsulaires de streptocoques donnent naissance àdes colonies muco ïdes
•Ce sont des bact éries aérobies dans lequel lacroissance est am élior éepar 10% de
dioxyde de carbone.
•Ils sont catalase négatif.
•Ils sont largement répandus dans lanature etse trouvent dans les voies respiratoires
sup érieures, letube digestif etdes voies génito-urinaires (la flore microbienne
normale).
•Ils sont un groupe hétérog ène de bact éries, etpas un seul syst ème suffit àles classer .
•La classification actuellement utilis éest bas ésur les caract éristiques de croissance
de lacolonie, exempe sur gélose au sang, lacomposition antig énique du groupe de
substances spécifiques de laparoi cellulaire etlaréaction biochimique
Streptocoques Streptocoques Streptocoques Streptocoques
Classification Classification Classification Classification desdesdesdes streptocoques: streptocoques: streptocoques: streptocoques: Bas ésur
1. Morphologie des colonies etde laréaction hémolytique sur gélose au sang
2. Sp écificit ésérologique spécifique de lasubstance du groupe de laparoi cellulaire
etd'autres antig ènes capsulaires de laparoi cellulaire
3. Réactions biochimiques etrésistance àdes facteurs physiques etchimiques
4. Caract éristiques Ecologique.
HHHHéééémolytique molytique molytique molytique rrrrééééaction action action action dededede streptocoques streptocoques streptocoques streptocoques ::::
l'h émolyse Aspect Désignation Exemple
Compl ète Incolore, clair, limpide ,
Zone étroitement définie
Bêta(β) S. pyog ènes
partiel streptocoque Décoloration verd âtre
(hémoglobine réduite)
Alpha (α) Viridans
Aucun Aucun changement Gamma (δ) Ent érocoques
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Classification Classification Classification Classification Lancefield Lancefield Lancefield Lancefield desdesdesdes streptocoques: streptocoques: streptocoques: streptocoques:
Les streptocoques produisent de groupes spécifiques Hydrates de carbone (C
des hydrates de carbone )identifi éàl'aide groupe antis érum spécifique .
Elle est désign éeA- HetK- V.
Cliniquement les streptocoques importants sont regroup éssous A, B,C,D,FetG.
Les principales esp èces etles groupes d'int érêtmédical
S. pyogenes ........... groupe de Lancefield
S. agalactiae ...........Lancefield groupe B
Ent érocoques ......... Lancefield groupe D
NB :streptocoques viridans etles streptocoques ana érobies ne sont pas regroup és
sous Lancefield classification .
Structure Structure Structure Structure antig antig antig antig éééénique nique nique nique ::::
1. Antig ène de laparoi cellulaire spécifique au groupe
La paroi cellulaire du streptococcique obtenu carbohydrate est àlabase de
Sérologique regroupement des streptocoques (groupes Lancefield AH ,KU )
2.Prot éine M
Ils sont trouv ésdans les projections comme des cheveux de lastreptococcique
Surface etdéterminer lavirulence
Facteur virulent majeur pour streptocoques du groupe A.
Ilexiste deux grandes classes structurales de laprot éine M(classe Ietclasse II)et
plus de quatre-vingts serotypes de prot éine Mde streptocoques du groupe A
La classe Iprot éine Mpeut être un facteur déterminant de lavirulence pour fièvre
rhumatismale
Conserve les domaines antig éniques sur laclasse IMprot éine induisent des anticorps
qui croisent avec letissu musculaire cardiaque
.3Tsubstance :Acide etthermolabile contrairement àlaprot éine M,etn'a aucune
relation avec lavirulence des streptocoques .
4.Prot éine R
Streptococcus pyogenes (streptocoques β-hémolytique du groupe A)
Le membre leplus pathog ène du genre
Ilest présent sous forme d'un commensal dans lenasopharynx dans une variable
proportion d'individus en bonne sant é.Ilproduit des diff érents types d'enzymes et
exotoxines .
Ce sont :
.1streptokinase :Fibrinolysine .
Ils'agit d'une enzyme prot éolytique active qui lyse de lafibrine par conversion
catalytique du plasminog ène en plasmine .
Aétéadministr épar voie intraveineuse pour letraitement de l'oed ème pulmonaire et
de thrombose art érielle etveineuse
.2Streptodernase :déoxyribonucl éase streptococcique
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Des mélanges de streptokinase etstreptodernase sont utilis ésdans "le débridement
enzymatique"
3NADase:. Nicotinamide adénine dinucleotidase
4hyaluronidase:. Facteur d'étalement
Elle dégrade lasubstance fondamentale du tissu conjonctif (acide hyaluronique) et
aide àlapropagation infectieux du micro-organisme
5: hémolysines. Deux types
Streptolysine OetStreptolysine S
Antistreptolysine Otitre d'anticorps> 1:200
Preuves àl'appui de lafièvre aigu ërhumatismale
2.32.32.32.3 Comparaison Comparaison Comparaison Comparaison desdesdesdes strstrstrstr ééééptolysines ptolysines ptolysines ptolysines
.6toxine érythrog ène: exotoxines pyrog ènes
Ilest responsable de l'éruption éryth émateuse dans lascarlatine.
.Infection de lapeau: imp étigo, cellulite, l'érysip èle
.Scarlatine
.Angine aigu ëàstreptocoque
.Infection de l'oreille: l'otite moyenne aigu ëetmasto ïdite
.La fièvre puerp érale :Septic émie originaires de l'ut érus infect é
.Maladies post-streptococcique: les maladies immunologiques
1. Rhumatisme articulaire aigu
Dommage immunologique des valves cardiaques etmusculaires suivant
Infection streptococcique sup érieure des voies respiratoires
Ilse présente cliniquement de lafièvre, des malaises, lapolyarthrite migratoire non
suppurative, cardite, éryth ème margin éetnodules sous-cutan és
2. Glom érulon éphrite aigu ëpost streptococcique
Dommages immunologique àlasuite d'une infection rénale de peau avec les
streptocoques
Elle se manifeste cliniquement par un œdème généralis édu corps, tension arteriel
élev ée,de prot éines etde sang dans l'urine,
rétention d'ur éeetleniveau de compl ément bas
.Fasciite nécrosante (gangr ène streptococcique): Vaste etrapidement propagation
nécrose de lapeau etdu tissu sous-cutan é
S.S.S.S. agalactiae agalactiae agalactiae agalactiae
Caract éristiques cliniques
.La septic émie néonatale, lapneumonie etlaméningite
.L'avortement septique
.L'infection puerp érale
hémolysines Stabilit éd'oxyg ène antig énique
Streptolysine O Non Oui
Streptolysine S Oui Non
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EntEntEntEnt éééérocoques rocoques rocoques rocoques
Caract éristiques cliniques
.Cause fréquente d'infection nosocomiale
.abc èsabdominal
.Endocardite bact érienne subaigu ë
Streptocoques Streptocoques Streptocoques Streptocoques viridans viridans viridans viridans
Par exemple. Streptococcus mitis
Streptococcus mutans
Streptococcus salivarius
Streptococcus sanguis
caract éristiques cliniques
.Endocardite bact érienne subaigu ë
Diagnostic Diagnostic Diagnostic Diagnostic dededede laboratoire: laboratoire: laboratoire: laboratoire:
LeLeLeLe prprprprééééllllèèèèvement vement vement vement ::::
S. pyog ènes -prélèvement de gorge, pus, de sang
S. agalactiae -haut prélèvement vaginal de lafemme; céphalo-rachidien etlesang
fluide de nouveau né
Ent érocoques -sang, du pus
Streptocoques Viridans -Sang
Frottis Frottis Frottis Frottis :immobiles cocci Gram positif en cha înettes
Culture, des tests biochimiques etdes tests de sensibilit é:
cultivent dans un environnement aérobie etana érobie àune temp érature de 35à37°C.
Cro ître dans des milieux ordinaires avec des colonies brillantes ou secs avec un
aspect blanc gris ou incolore.
S. pyog ènes montrent une zone claire d'h émolyse en gélose au sang.
Ne pousse pas sur gélose mac Conkey.
Bacitracine sensible.
PYR-positif
S. agalactiae –montre une zone claire d'hémolyse en gélose au sang
Peut montrer une double zone d'h émolyse lors d'une incubation ana érobie
Actif dans l'hydrolyse de l'hippurate
CAMP-test est utilis épour identifier les bact éries.
Streptocoques Viridans -montre de décoloration verd âtre au gélose au sang .
Optochine résistant .
Pas solublilit édans les sels biliaires .
Ne fermente pas inuline .
Ent érocoque non hémolytique ou αhémolytique change dans lagélose au sang .
Cro ître en présence de 6,5 %de NaCl .
Pousse sur mac Conkey
réduction de laliqueur de tournesol .
Identified by litmus milk reduction test.
PYR- positif
Bile esculine positif
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Variante Nutritionnel streptocoques (Streptocoques nutritionnel déficient )
Par exemple .Abiotrophia adjacens
Abiotrophia defectiva
.Exiger pyridoxal ou lacyst éine pour lacroissance dans lagélose au sang
.Habituellement αHémolytique ou non hémolytique
.causer l'endocardite infectieuse
Traitement:
Streptocoques autres que les ent érocoques ...... Pénicilline /Erythromycine
Ent érocoques .................................................... Pénicilline +gentamicine
Streptocoques Streptocoques Streptocoques Streptocoques pneumonie pneumonie pneumonie pneumonie ((((Streptococcus pneumoniae )
•En forme de lancette fastidieuse Gram positif en diplocoques.
•Poss éder une capsule de polysaccharide qui permet letypage antis érums spécifiques.
•Trouv écomme une flore normale dans les voies respiratoires sup érieures.
Pneumocoque Pneumocoque Pneumocoque Pneumocoque
Structure Structure Structure Structure antig antig antig antig éééénique: nique: nique: nique:
.Polysaccharide capsulaire: pathog énicit édéterminant avec propri étéanti-
phagocytaire. Ilexiste plus de 80 serotypes de bact éries bas ées sur letypage
capsulaire.
Identifi épar capsule gonflement test (réaction de Quellung ).
.substance C: antig ène associ éàlaparoi cellulaire
.prot éine Mantig ène
.prot éase IgA1: enzyme qui clive IgA1
Signes cliniques:
.pneumonie lobaire
.L'otite moyenne
.sinusite
.Bact ériémie ........... méningite
.endocardite
.L'arthrite septique
Diagnostic Diagnostic Diagnostic Diagnostic dededede laboratoire: laboratoire: laboratoire: laboratoire:
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LesLesLesLes prprprprééééllllèèèèvements vements vements vements :expectoration, sang, liquide céphalo-rachidien, écoulement de
l'oreille etde drainage des sinus.
Frottis: forme Lancet gram positif en diplocoques
Culture: lameilleur Cultire dans les milieux de gélose chocolat enrichie en
atmosph ère CO2
-montre une α-hémolytique, aspect de lacolonie rédige
Apparence: centre creux colonie en raison de l'autolyse spontan éedes bact éries âgées.
-Jeunes colonies ressemblent àdes gouttes de ros éeen raison de lacapsule.
-Soluble bile, ferment inuline.
-Optochine sensible.
SSSSéééérologie rologie rologie rologie :réaction Quellung
.Bonne pour l'identification rapide de S. pneumoniae dans un échantillon frais.
Principe Principe Principe Principe :
.Mélanger serotypes spécifique de S. pneumoniae avec du sérum anti-polysaccharide
spécifique du même serotypes ou avec un anti-s érum polyvalent sur une lame.
.Cherchez l'apparence de gonflement de lacapsule sous de microscope àl'objectif 100X
Treatement Treatement Treatement Treatement :amoxicilline, chloramph énicol, Les céphalosporines de 3
eme
génération
PrPrPrPr éééévention vention vention vention etetetet contr contr contr contr ôôôôle:le:le:le:
Le vaccin conjugu éantipneumococcique: immunisation des personnes avec de type
spécifique polysaccharidique vaccin
Réaction biochimique pour diagnostiquer les streptocoques
.test de lasolubilit éde labile
.Test de réduction de lait de tournesol
.CAMP-test
.test alaBacitracin
.test d’optochine
Diff Diff Diff Diff éééérenciation renciation renciation renciation desdesdesdes espespespesp èèèècescescesces dededede streptocoques streptocoques streptocoques streptocoques
EspEspEspEsp èèèècescescesces catalase catalase catalase catalase Bacitracin Bacitracin Bacitracin Bacitracin Optochine Optochine Optochine Optochine lait lait lait lait dededede tournesol tournesol tournesol tournesol CAMP CAMP CAMP CAMP
S. pyogenes -ve-ve-ve-ve ++++veveveve -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve
S. agalaciae -ve-ve-ve-ve -ver -ver -ver -ver -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve ++++veveveve
Ent érocoques -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve +ve+ve+ve+ve -ve-ve-ve-ve
S.Viridans -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve ----veveveve
S.pneumoniae -ve-ve-ve-ve -ve-ve-ve-ve ++++veveveve -ve-ve-ve-ve ----veveveve