El tamaño del epitopo de células T queda determinado por el tamaño del surco de unión al Ag de El tamaño del epitopo de células T queda determinado por el tamaño del surco de unión al Ag de
la molécula de MHC.la molécula de MHC.
Las moléculas de MHC-I unen péptidos de entre 8 y 11 aminoácidos.Las moléculas de MHC-I unen péptidos de entre 8 y 11 aminoácidos.
Las moléculas de MHC-II unen péptidos de entre 11 y 17 aminoácidos.Las moléculas de MHC-II unen péptidos de entre 11 y 17 aminoácidos.
Los péptidos antigénicos reconocidos por células T forman un complejo trimolecular junto con el Los péptidos antigénicos reconocidos por células T forman un complejo trimolecular junto con el
TCR del linfocito T y el MHC de la célula presentadora o diana. El antígeno reconocido por células TCR del linfocito T y el MHC de la célula presentadora o diana. El antígeno reconocido por células
T tiene dos zonas de unión: una para ligarse al TCR, denominada epitopo, y otra para engarzar al T tiene dos zonas de unión: una para ligarse al TCR, denominada epitopo, y otra para engarzar al
MHC, denominada agretopo. MHC, denominada agretopo.
Los péptidos antigénicos implicados en el complejo trimolecular proceden del procesamiento Los péptidos antigénicos implicados en el complejo trimolecular proceden del procesamiento
intracelular del inmunógeno proteico original. intracelular del inmunógeno proteico original.
Los antígenos reconocidos por las células T presentan péptidos anfipáticos. Precisamente, quizá Los antígenos reconocidos por las células T presentan péptidos anfipáticos. Precisamente, quizá
la función del procesamiento sea "desplegar" el Ag y exponer estas regiones internas anfipáticas, la función del procesamiento sea "desplegar" el Ag y exponer estas regiones internas anfipáticas,
de modo que la porción hidrófoba suele actuar de agretopo, mientras que la porción hidrófila de modo que la porción hidrófoba suele actuar de agretopo, mientras que la porción hidrófila
actúa de epitopo propiamente dicho.actúa de epitopo propiamente dicho.
Por programas de ordenador es posible predecir en una proteína aquellas regiones anfipáticas de tamaño Por programas de ordenador es posible predecir en una proteína aquellas regiones anfipáticas de tamaño
adecuado que teóricamente podrían actuar como péptidos antigénicos. Esto se refleja en el llamado "índice adecuado que teóricamente podrían actuar como péptidos antigénicos. Esto se refleja en el llamado "índice
anfipático", y se está aplicando actualmente al diseño de vacunas sintéticas peptídicas (como en el caso de anfipático", y se está aplicando actualmente al diseño de vacunas sintéticas peptídicas (como en el caso de
la malaria).la malaria).
También se puede recurrir por ordenador a medir el "índice de protrusión" de distintas partes de las También se puede recurrir por ordenador a medir el "índice de protrusión" de distintas partes de las
proteínas: las zonas con menor protrusión son mejores candidatas a funcionar como péptidos de células T.proteínas: las zonas con menor protrusión son mejores candidatas a funcionar como péptidos de células T.
Debido a que los Ag reconocidos por células T lo son unidos a las moléculas de MHC del Debido a que los Ag reconocidos por células T lo son unidos a las moléculas de MHC del
individuo, y debido a que a su vez existe una gran diversidad de alelos de MHC en las individuo, y debido a que a su vez existe una gran diversidad de alelos de MHC en las
poblaciones de una especie, los epitopos inmunodominantes en cada individuo dependen en poblaciones de una especie, los epitopos inmunodominantes en cada individuo dependen en
parte del juego de moléculas MHC de ese individuo (lo cual, depende de su dotación genética, parte del juego de moléculas MHC de ese individuo (lo cual, depende de su dotación genética,
obviamente). En una proteína sólo una minoría de zonas peptídicas tienen capacidad para unirse obviamente). En una proteína sólo una minoría de zonas peptídicas tienen capacidad para unirse
a las moléculas MHC de cada individuo, y de esas zonas, sólo algunos estimulan de hecho a la a las moléculas MHC de cada individuo, y de esas zonas, sólo algunos estimulan de hecho a la
célula T célula T