1 Herramientas Químicas Computacionales (softwares) para el Modelaje Molecular. “Un vistazo a la Química Computacional y una oportunidad en medio de la Pandemia COVID-19” Presentado por: Lic. Jesús Raimond Morón M. Caracas, agosto de 2020
Esquema de reacción del Ligando (L) 2,4-bis( ciclohexano )diespiro-1,2,3,4,4a,5,6,7-octahidro-(1 H ,3 H )-quinazolina-8-carboditioato de metilo . Contreras RR et al. 2001
Reacción de síntesis de los complejos del tipo [M(II)LCl 2 ]. M(II) = Co(II), Ni(II), Cu(II), Cd(II),Zn(II), Fe(II) y Pd(II). Nag et al. Inorganica Chimica Acta . 1975; 14; p. 133-141 3 Síntesis de los complejos.
4 Cálculo computacional Avogadro Gabedit Spartan Plus 14
5 Cálculo computacional Interfaz: MOPAC 2009 y Spartan Plus Geometría de Mínima Energía Energía de los Orbitales Moleculares Área y Volumen Molecular Grupo puntual Métodos semiempíricos AM1 – ligandos PM6 - complejos
6 Cálculo computacional Ligando Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -28,75 -8,14 -0,87 4,35 374,19 376,23 C1 EME HOMO LUMO
7 Cálculo computacional Complejos de COBRE (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -254,12 -7,52 -0,87 7,24 425,22 376,23 C1
8 Cálculo computacional Complejos de níquel (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -237,87 -8,57 -1,09 9,98 427,91 425,73 C1 EME aHOMO bHOMO
9 Cálculo computacional Complejos de níquel (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -237,87 -8,57 -1,09 9,98 427,91 425,73 C1 EME aHOMO bHOMO aLUMO bLUMO
10 Cálculo computacional Complejos de Cobalto (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -178,06 -7,15 -3,36 11,31 425,78 424,74 C1 EME EME HOMO LUMO
11 Cálculo computacional Complejos de Hierro (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -389,61 -3,09 4,29 16,95 433,52 424,53 C1 EME EME aHOMO bHOMO
12 Cálculo computacional Complejos de Hierro (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -389,61 -3,09 4,29 16,95 433,52 424,53 C1 EME EME aLUMO bLUMO
13 Cálculo computacional Complejos de Cinc (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -338,80 -8,97 -1,33 11,28 451,33 431,57 C1 EME EME EME HOMO LUMO
14 Cálculo computacional Complejos de Cadmio (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -356,15 -8,76 -1.53 20,08 458,58 433,72 C1 EME EME EME HOMO LUMO
15 Cálculo computacional Complejo de paladio (II) Propiedades Energía (Kjmol-1) HOMO (eV) LUMO (eV) Momento dipolar ( Debye ) Área (A 2 ) Volumen (A 3 ) Grupo puntual -189,89 -7,83 -1.44 18,97 453,74 431,82 C1 EME HOMO LUMO
16 Cálculo computacional Espectro Teórico calculado para el LIGANDO Espectro Teórico calculado para el complejo de Hierro
17 Cálculo computacional Espectro Teórico calculado para el complejo de Cinc Espectro Teórico calculado para el complejo de Paladio
18 Cálculo computacional Espectro Teórico calculado para el complejo de Cobre Espectro Teórico calculado para el complejo de Cobalto
19 Cálculo computacional Espectro Teórico calculado para el complejo de Níquel Espectro Teórico calculado para el complejo de Cadmio
20 Espectroscopia vibracional infrarroja (IR)-experimental Asignación L Cu(II)L Co(II)L Ni(II)L Fe(II)L Pd(II)L Cd(II)L νN‒H(libre) 3276 3292 3404 3348 3136 3296 3346 ν(N‒H) 3208 3246 3278 3278 3378 3416 3520 ν a (CH 2 ) 2932 2926 2932 2932 2932 2930 2932 ν s (CH 2 ) 2848 2860 2860 2860 2860 2856 2852 ν a (C=C)+ν a (C=N) 1588 1618 1702 1606 1602 1582 1586 ν s (C=C) 1478 1446 1446 1444 1440 1440 1440 ν s (C=N)+ν a (C=S) 1350 1368 1346 1366 1366 1402 1388 ν a (S‒CH 3 ) 1248 1250 1252 1160 1252 1252 1248 ρ-CH 2 940 958 1010 986 1026 980 1010 ν a (CSSCH 3 ) 910 914 908 918 942 808 938 ν s (CSSCH 3 ) 684 684 686 684 656 ‒ 682 V(O‒H)/H 2 O hidratación ‒ 3392 3424 3348 ‒ ‒ ‒ M-N ‒ ‒ ‒ ‒ 480 ‒ ‒ Resumen de absorciones en el infrarrojo medio del ligando y sus respectivos complejos .