> La oxidación de compuestos orgánicos
> Catabolismo de quimioheterótrofos en aerobiosis
= Transformación de compuestos orgánicos en pirúvico
x Generalidades de las rutas catabólicas
x Ruta glucolítica de Embden-Meyerhof-Parnas
x Ruta de Entner Doudoroff
x Ruta de las pentosas fosfato
Transformación de pirúvico a CO): Ciclo TCA: flujo de electrones al
CO, y reducción del NAD*
Transporte de electrones en cadena respiratoria aerobica:
transportadores y diversidad
> Catabolismo de quimioheterötrofos en anaerobiosis
= Larespiraciön anaeróbica: características y tipos
= La fermentacién: concepto y tipos generales y significado
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Conocer el flujo de energía a través de las rutas de respiración y
fermentación de la glucosa
Papel de las reacciones redox en la fosforilación oxidativa
Conocer las principales características de las rutas de respiración y
fermentación
Familiarizarse con el acoplamiento entre energía y flujo de electrones
en las rutas de respiración y fermentación
Describir las funciones del ciclo de Krebs
Conocer las funciones de los transportadores de electrones en las
respiraciones celulares
Definir respiración anaerobia y conocer que tipos de microorganismos
llevan a cabo este proceso y en que circunstancias.
Conocer las diferencias entre respiración aerobia y anaerobia
Describir la fermentación su importancia y/o significado
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
> La oxidación de compuestos orgánicos
> Catabolismo de quimioheterótrofos en aerobiosis
= Transformación de compuestos orgánicos en pirúvico
x
x
F
Generalidades de las rutas catabólicas
Ruta glucolítica de Embden-Meyerhof-Parnas
Ruta de Entner Doudoroff
Ruta de las pentosas fosfato
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
[Energy sauce H
Metabolismo en
Quimioheterotrofos
/ Catabolismo Anabolismo
Componentes
celulares,
Productos
Energia
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
El
Transportadores
de electrones
Metabolismo en
Quimioheterotrofos
Aceptores finales de electrones
O2
NO; , SOS
CO,
Pyruvic acid
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Catabolismo de quimioheterótrofos en aerobiosis
Compuesto orgánico
« El TCA proporciona intermediarios para la
síntesis de aminoácidos y pirimidinas
+ Los microorganismos tienen reacciones
anapleróticas que alimentan el ciclo en
intermediarios para que pueda continuar
activo durante la biosíntesis.
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Ciclo del glioxalato
Glyoxylate cycle
En aerobios que crecen
cae sobre acetato o ácidos
N aaa > grasos. Se inducen las
Acetate Be enzimas clave de este
aes ciclo y se reprime la
Lt, \ isocitrato deshidrogenasa
Fumarate
Nature Reviews | Molecular Cell Biology
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Algunos microorganismos pueden realimentar intermediarios del TCA
mediante la
No ejerce la misma función que la fijación de CO, en autötrofos
La fijación de CO, anaplerótica simplemente reemplaza a
intermediarios del TCA y mantiene así el balance metabólico
Algunos microorganismos utilizan la
sintetizar oxalacetato. Ej. Arthrobacter, Pseudomonas.
Piruvato + CO, Oxaloacetato
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Fosfoenolpiruvato carboxilasa
+ Algunos microorganismos utilizan la enzima
fosfoenolpiruvato carboxilasa para realimentar en OAA
el TCA. Ej. E. coli y Salmonella typhimurium
Relaciones entre las principales rutas glucolíticas y el TCA.
apra
«Las rutas son: EMP, ED y PPP; las
dos últimas convergen con la EMP a
nivel del Gliceraldehido 3P. Todas
producen piruvato que es oxidado a
acetil-CoA.
«En heterotrofos respiradores, el
acetil-Co-A es oxidado a CO, en el
TCA. Los electrones se conservan en
NAD(P)H y FADH, y se transfieren a la
c.t.e. con la formaciön de ATP.
ee acid
«En heterotrofos fermetadores el
NADH se reoxida por un aceptor final
orgänico que se genera durante el
catabolismo.
«El TCA no opera como ruta oxidativa
durante el crecimiento fermentativo.
NADH —
San BH,
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Esquema de la respiración aeróbica en
heterotrofos
Glucolisis +
TCA
GLUCOSE —————_ 6 CO2
4
NADH) }
Regeneración de
los cofactores ons
i ATP-)— PMF = —— ansporte de
oxidados electrones
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
: principal sistema generador de
energía en procariotas respiradores. Acoplan el flujo de electrones en la
membrana a la creación de un potencial electroquímico de protón.
Los electrones fluyen desde los donadores primarios a aceptores terminales
a través de una serie de transportadores electrónicos.
La energía para producir el potencial protónico deriva de la diferencia de
potenciales electrodos de los transportadores así se convierte la diferencia
de potencial de electrodos en potencial electroquímico que puede servir
para producir ATP, rotación flagelar y otras actividades de la membrana
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Transportadores de electrones y diversidad
Potenciales de reducción Potenciales de reducción
más electronegativos más electropositivos
Dependiendo de la fuente de electrones las bacterias pueden
sintetizar y sustituir un complejo deshidrogenasa por otro.
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
AH, —? DESHIDROGENASAS —> QUINONAS —> OXIDASAS —> O,
Succinate ——, a
NADH == Q———* aora as Cota 2
Glycerot 3.P— ——
Escherichia coli
(highly aerobic) Ni
Eich dle) (aniderresisten)
Mterocoecas NADH =P MK bide — ats
Iysodeikiieus Glycerol PT
Azotobacter y Q * baso, ae
vinelanda SS ds \ — d (eyanide resistant)
ethanol
ann Ne #0
Sucsinate ——
Pseudomonas AMI NADH — Q— bye —
Las cadenas transportadoras procariöticas suelen ser ramificadas a nivel de
las deshidrogenasas o de citocromos.
Las bacterias pueden alterar sus c.t.e. según las condiciones de crecimiento
especialmente a la disponibilidad de oxígeno
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Esquema de la respiración aeróbica en
heterotrofos
Glucolisis +
TCA
GLUCOSE —————_ 6 CO2
4
(Snap )
Regeneración de
los cofactores ATPasa Sistema de
: PPM 9 — transporte de
oxidados pl electrones
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
ADP + P,
es la fraccion
catalitica
Canal de protones a tu wine
entre elexteriory | MAMA ill All 2
CYTOPLASM
el citoplasma A | dl
CU = ENVIRONMENT
Estructura y función de la ATP sintetasa de membrana: funciona como una canal de protones entre el
citoplasma y el exterior. La fraccion F1 es la catalítica responsable de la conversión del ATP y ADP+
Pi. La fracción FO está integrada en la membrana responsable del paso de protones a través de la
membrana (proteína conductora de protones).
Las ATP-asas de membrana
El ATP y el gradiente de protones
se pueden considerar como formas diferentes e interconvertibles de energía celular.
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Rendimiento en ATP de la oxidación de la glucosa en
respiración aeróbica (eucariotas y algunas bacterias)
Glycolytic Pathway
Substrate-level phosphorylation (ATP) 2 ATPA
Oxidative phosphorylation with 2 NADH 6 ATP
2 Pyruvate to 2 Acetyl-CoA
Oxidative phosphorylation with 2 NADH 6 ATP
Tricarboxylic Acid Cycle
Substrate-level phosphorylation (GTP) 2 ATP
Oxidative phosphorylation with 6 NADH 18 ATP
Oxidative phosphorylation with 2 FADH 4 ATP
Total Aerobic Yield 38 ATP
“ATP yields are calculated with an assumed P/O ratio of 3.0 for NADH and 2.0 for FADH;
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
> Catabolismo de quimioheterótrofos en anaerobiosis
= Larespiración anaeróbica: características y tipos
= La fermentaciön: concepto y tipos generales y significado
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Catabolismo de quimioheterótrofos en anaerobiosis
"La respiración anaeróbica: características y tipos
Glucolisis +
TCA
GLUCOSE ————————_@- 6 C02.
ATPasa
ATP <>
Fumarato
CO, : metanogénesis
Aceptores terminales diferentes del O, Oxianiones de nitrógeno
Azufre y oxianiones de S
lôn ferroso y otros
Los metanógenos son un grupo importante
de reductores de CO). Anaerobios obligados
one del dominio Archaea que producen metano
pes como producto final.
Er : La reacción:
AR à = CO, +H, + H* >CH, + H,0
es)
7
Em u or Ey (v)=- 0.24
Generaciön de un gradiente de protones durante la metanogenesis.
Los metanogenos utilizan los carbonatos y lo convierten en metano utilizando
hidrögeno como fuente de electrones.
MPH: es un transportador de electrones.
Los electrones procedente del H, reducen al F,,, (Coenzima) y este a la MPH
(metanofenacina) que los transfiere a través del cit b a la reductasa que se encarga de
reducir el CO, a CH,
31
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Respiración anaerobia de nitratos y nitritos: reducción
desasimiladora de nitratos
Periplasm
Aerobios y anaerobios
facultativos
Ey (v)=+0.4
Desnitrificacion en la membrana: DH: NADH deshidrogenasa;
NAR: nitrato reductasa; NIR: nitrito reductasa; NOR: NO
reductasa y N¿OR: N¿OR reductasa
Las enterobacterias solo llevan a cabo la respiración de nitratos a nitritos (nitrato
reductasa).
Las bacterias desnitrificantes (Pseudomonas aeruginosa, Paracoccus
desnitrificans, Rhodobacter sphaeroides) pueden además reducir los nitritos a
gases en un proceso conocido como desnit ió 32
Metabolismo en quimioheterótrofos
Procesos de transporte de electrones en E. coli: respiración aeróbica y
anaeróbica con nitratos. Bajo condiciones de alta tensión de oxígeno en
el primer caso se translocan más protones que en condiciones de bajo
nivel de oxígeno y con nitratos en el medio externo.
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Comparación de las reducciones asimiladoras y desasimiladoras de nitratos
Nitrato reductasa NO Nitrato reductasa
Asimiladora; =
reprimida por NH,
desasimiladora;
desreprimida en anoxia
Amoniaco (NHs) Reducción
Ly desasimiladora de
amoniaco (bacterias)
Nitrito reductasa Nitrito reductasa
Asimiladora; desasimiladora;
reprimida por NH; desreprimida en anoxia
Hidroxilamina Oxido nítrico (NO) —» f
[NH,OH]
Oxido nítrico reductasa;
Desreprimida por anoxia
Oxido nitroso (N,0) —> À
Oxido nitroso reductasa;
Productos finales son:
Incorporados al material
Amoniaco (NH3) celular
Excretados al medio ———=> Desreprimida por anoxia
Nitrógeno orga
(R-NH,) Nitrógeno (N) — ?
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Respiración anaerobia de sulfatos: reducción
desasimiladora de sulfatos
Outside Inside
Cytoplasmic
membrane
Pyruvate — > Acetato
Ha
Suffite
|
Generación de gradiente de protones en una bacteria sulfato reductora. El H,
externo puede formarse también como producto de fermentación además de
por el catabolismo de lactato y piruvato
Bacterias sulfato reductoras
Hábitat: ambientes anaerobios marinos ricos en óxidos de azufre *
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Comparación de las reducciones asimiladoras y desasimiladoras de sulfatos
app
ses —— Bars
en |
AMP
so?
=|
ES]
y
Excreción
Reducción
desasimiladora de
sulfato
Sulfito reductasa
APS nase
NADP*
res)
Bar
60,
6 “|
APS: Adenosina 5' fosfosulfato
| PAPS: Fosfoadenosina 5' fosfosulfato
+
Compuesto de azufre
orgánico (cisteina, metionina)
Reducción
asimiladora de
sulfato
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Respiración anaerobia de hierro férrico:
reducción de hierro férrico
Fe* es abundante en los hábitat
El potencial de reducción es lo suficientemente electropositivo + 0.2 V
En quimioorganotrofos (compuestos orgánicos aromáticos)
ie ai Anaerobios facultativos y
Ej: Geobacter, Geospirillum estrictos
a
Los microorganismos que utilizan óxidos de Fe% insolubles como aceptores de
electrones pueden tener una función importante en los ciclos de la materia en
sedimentos acuáticos y en biorremediaciôn de aguas subterráneas contaminadas con
metales. Geobacter metallireducens, es un ejemplo que es capaz de obtener energía a
través de la reducción desasimiladora de hierro, manganeso y otros metales. Además
este microorganismo puede oxidar compuestos aromáticos contaminantes. Estas
características hacen a este microorganismo un agente posible de biorremediación
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Respiración anaerobia del fumarato
Generación de gradiente de protones con fumarato como aceptor de
electrones.
El mecanismo redox con deshidrogenasa y fumarato reductasa (FR)
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Otros aceptores de electrones orgánicos: DMSO y TMAO
DMSO: dimetilsulféxido Anaerobios facultativos y
estrictos
HOJA 2e
|
cH, 2H
Aw + HO
HC CH
dimetilsulfóxido dimetilsulfuro Ej" (v) = + 0.16
TMAO: óxido de trimetilamina
CH;
ls 2e
H¿C-N— cH, ——> [em], N + HO
2H* 3 4
o E, (v) = + 0.13
óxido de trimetilamina trimetilamina
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
a Ocurre en ausencia de oxígeno cuando los niveles de oxígeno son muy bajos
a Hay cadena transportadora de electrones con los componentes básicos:
AH, — deshidrogenasa — quinona >| reductasa|— B
a Es una respiración en la que actúan otros aceptores de electrones diferentes de
oxígeno: nitratos, nitritos, sulfato, Carbonato entre otros.
u Tiene un rendimiento energético inferior a la respiración aeróbica porque los
aceptores de electrones poseen potenciales de reducción menos positivos que el O, y
por tanto la diferencia de potencial entre el donador y el aceptor es menor.
a Es útil porque permite la producción de ATP por fosforilación oxidativa en ausencia de
oxígeno.
a Además las bacterias que realizan estas respiraciones pueden vivir en hábitat en los
que las aerobias no pueden hacerlo e interviene en los ciclos de la materia en la
biosfera.
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
La fermentación
La fermentation resulta ne numerosos productos finales que depende
de:
1. Tipo de microorganismo
2. Del sustrato
3. De las enzimas activas presentes
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
La fermentación: concepto
-Reoxidacion de los aceptores de electrones reducidos por
metabolitos producidos en la propia ruta catabólica.
SUBSTRATE
«Los aceptores de electrones son endógenos y orgánicos
ADP + Pi — peo;
——.naph, *Reacciones redox citoplasmáticas
-ATP por fosforilación a nivel de sustrato
OXIDIZED «No se quema completamente el sustrato
INTERMEDIATE
NADH2 «Rendimiento en ATP menor que en las respiraciones
«Donadores de electrones siempre orgánicos
REDUCED »Ocurre sin la participación del oxígeno
END PRODUCT so =: ge
-Excrecion de gran cantidad de compuestos orgánicos
reducidos como alcoholes, ácidos, H, ,
AH, +NAD* + Pi + ADP > B +NADH+H* +ATP
B + NADH+H* > BH, (excretado) + NAD*
Acoplamiento de oxido-reducción de dos
aminoácidos (glicina y alanina) en Clostridium
sporogenes.
Alanina es el donador de electrones y la
glicina es el aceptor.
Productos: acetato, NH, y CO,
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Algunas aplicaciones de los productos de
fermentación
‘Acetone, sopropanal
|
Queso suizo yogures, Quitaesmalte Vinagre
queso
cheddar,
salsa de soja
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Conservación de energía en bacterias anaerobias
. ATP por fosforilación a nivel de sustrato (fermentadoras)
. ATP por respiración anaerobia ( en facultativas y anaerobias): Aceptor
exógeno.
. Generación del Ap (potencial de membana) en fermentadores:
Por acción de la ATPasa de membrana en sentido reverso
Utilización del fumarato como aceptor en respiración anaerobia
Oxidación periplasmica de H, o formato (Wolinella succinogenes)
Por simporte de ácidos orgánicos: Lactato/ H* ; Succinato / Na*
Descarboxilación del Oxalacetato ligado a salida de Na* ( Klebsiella)
2 Na" citopiasma + OAA + 2 Na" asno + Piruvato + CO, us,
Oxalacetato descarboxilasa|
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Cambios metabólicos en anaerobios facultativos a la anaerobiosis
Aerobiosis
Respuestas adaptativas de E. coli a condiciones anaerobias:
En aerobiosis: el TCA oxidativo proporciona electrones a la NADH deshidrogenasa y a la
succionato DH
En anaerobiosis el TCA no es cíclico es reductivo porque no se produce a-cetoglutarato DH.
Se altera la c.t.e. y los electrones no van al oxígeno sino a otras moléculas. Cuando está
presente el nitrato se sintetiza nitrato reductasa.
En ausencia de aceptores exógenos para la respiración anaeróbica, la principal ruta de
obtención de energía es la Fermentación
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
Conocer el flujo de energía a través de las rutas de respiración y
fermentación de la glucosa
Papel de las reacciones redox en la fosforilación oxidativa
Conocer las principales características de las rutas de respiración y
fermentación
Familiarizarse con el acoplamiento entre energía y flujo de electrones
en las rutas de respiración y fermentación
Describir las funciones del ciclo de Krebs
Conocer las funciones de los transportadores de electrones en las
respiraciones celulares
Definir respiración anaerobia y conocer que tipos de microorganismos
llevan a cabo este proceso y en que circunstancias.
Conocer las diferencias entre respiración aerobia y anaerobia
Describir la fermentación su importancia y/o significado
Tema 9. Metabolismo en quimioheterótrofos
BIBLIOGRAFÍA
1.LIBROS DE TEXTO:
Brock Biología de los microorganismos (10* Edición). Pearson Prentice
Hall. (2003).
Brock Biologia de los microorganismos (10%
Edición). Pearson Prentice Hall. (2003).
Brock
Biología de los microorganismos (10* Edición). Pearson Prentice Hall. (2003).
Microbiología (5* Edición). Prescott, Harley y
Klein. Mc Graw-Hill (2004).