La historia se desarrolla en , Alejandría, Egipto, bajo el imperio romano. Nos mucha la lucha por el poder en Ágora. Su educación consistía en Historia, Filosofía, Astronomía, Matemáticas, Física, Sociología. Estaban divididos en clases sociales.
A lo largo de la película el personaje de Hipatia se emociona ante los textos de los Elementos de Euclides, el cono de Apolonio, el sistema geocéntrico de Claudio Ptolomeo y el heliocéntrico de Aristarco de Samos. Hipatia se empeña en resolver el enigma astronómico que plantean los planetas errantes vislumbrando en la elipse.
los cristianos muestran su fortaleza burlándose del dios greco-egipcio Serapis, a quien consideran un dios pagano. La actitud provocadora de los cristianos desencadena un ataque mortal contra ellos y comienza una lucha entre las distintas facciones religiosas -cristianos , greco-egipcios, judíos Sólo algunos recibían educación, los esclavos sólo apoyaban al maestro en algunas cosas
En Alejandría hay muchos conflictos entre ellos, la religión , hay constantes enfrentamientos entre los que son conocidos como paganos, quienes creen en sus diversos dioses y los cristianos. Los cristianos regularmente se presentaban en el centro de la ciudad predicando su fe cristiana y esto incomodaba a los lideres paganos, que frecuentemente discutían contra ellos.
E l cristianismo en un principio había sido duramente perseguido durante el imperio romano, pero más tarde consigue hacerse mayoritario y oficial en el imperio y de perseguido se convierte en perseguidor de lo que entonces van quedando como minorías religiosas. Esta película muestra la destrucción de la biblioteca alejandrina y como el cristianismo en cierto momento afecto en cuestiones muy importantes la filosofía y el descubrimiento de nuevas cosas.