Pesquisa com PubMed, 23.06.2020

Pesquisa com PubMed - Curso de extensão Super 8 - Bibliotecas UFRGS

1. Currículo
Lattes


Dirce Maria Santin
Biblioteca Setorial ICBS

Apoio: Vanessa Souza
Biblioteca Central
Pesquisa com
PubMed


Dirce Maria Santin
Apoio: Rosa Mesquita

Biblioteca ICBS-UFRGS
2020

2. Módulos do curso

Bibliotecas UFRGS e Sabi+
Introdução à Pesquisa com Gerenciadores
Pesquisa no Portal Capes
Pesquisa no repositório institucional Lume
Pesquisa em bases de dados específicas
O pesquisador e sua produção científica
Gerenciadores Mendeley ou Zotero
Trabalho acadêmico com Mendeley ou Zotero
Ética na publicação científica
Currículo Lattes
Pivot – Financiamento acadêmico
O Sistema de Bibliotecas da UFRGS
(SBUFRGS) oferece o curso de extensão
Super 8 – Pesquisa e Uso da Informação
Científica visando expandir a formação
acadêmica por meio de capacitações que
desenvolvam o domínio de técnicas de
pesquisa e uso da informação.

O curso é aberto a docentes, técnicos, alunos
e comunidade externa.

As horas de curso poderão ser aproveitadas
como créditos complementares.

Confira a agenda
e inscreva-se:
www.ufrgs.br/super8

3. Base de dados referencial de acesso livre
produzida pelo National Center for Biotecnology Information
(NCBI), ligado à National Library of Medicine (NLM) dos EUA.

Cobertura
Mais de 30 milhões de referências da literatura
biomédica internacional.
Ciências Biológicas, Ciências da Saúde e áreas correlatas.

4. PubMed é a base de dados referencial que reúne conteúdos da
MEDLINE e diversos recursos do NCBI.
Cobertura: 1946-presente + referências 1809-1945.
PubMed Central é a base de texto completo de periódicos de
acesso aberto indexados pela PubMed.
MEDLINE é a base bibliográfica da NLM. Principal
componente da PubMed. Cobertura (1946-presente). Artigos
da MEDLINE são indexados com os termos MeSH.

6. Antes de iniciar a pesquisa
Defina a questão de pesquisa;
Identifique os termos de pesquisa: MeSH – Medical
Subject Headings, sinônimos, variações e termos livres.
Elabore estratégias de busca com operadores
booleanos (AND, OR, NOT) e outros operadores de
pesquisa: colchetes - ( ); truncagem - * e aspas - “ ”.

7. AND
Conecta todos os termos da pesquisa. Default na PubMed.
Exemplo: COVID-19 AND Hydroxychloroquine.
Recupera documentos que contêm os dois termos.
OR
Acrescenta termos para ampliar a pesquisa. Use-o para pesquisar
variações e sinônimos.
Exemplo: COVID-19 OR (2019-nCoV disease).
Recupera documentos que contêm pelo menos um dos termos.
NOT
Exclui os registros que contêm determinado termo de pesquisa.
Exemplo: COVID-19 NOT Arbidol.
Recupera os documentos em que ocorre COVID-19, excluindo
aqueles que também contêm Arbidol.
Operadores booleanos

8. Use parênteses quando houver mais de um operador booleano.
Use também com termos compostos na PubMed.
Exemplo: COVID-19 AND (Hydroxychloroquine OR Chloroquine OR
Azithromycin)
Recupera documentos segundo a lógica de precedência definida.
Use asterisco para indicar variações a partir do prefixo ou radical.
Exemplo: epidem*
Recupera documentos com termos variantes ou no plural (epidemy,
epidemic, epidemiological etc.). Não usar * com aspas.
Use aspas em termos compostos. Sugere-se testar o uso de aspas e
parênteses na PubMed e escolher a melhor alternativa.
Exemplo: “COVID-19 vaccine” ou (COVID-19 vaccine).
Recupera documentos que contêm os três termos juntos.
“ ”
*
( )
Operadores de proximidade

9. PICO e PICo
PESQUISA CLÍNICA
Auxilia na construção de uma pergunta de
pesquisa e na busca de evidências.
P

POPULAÇÃO,
PACIENTE
(IDADE, RAÇA,
SEXO,
MEDICAÇÃO
QUE UTILIZA,
STATUS DE
SAÚDE) OU
PROBLEMA
I

INTERVENÇÃO,
INDICAÇÃO OU
INTERESSE
C

PROCEDIMENTO
PADRÃO,
INTERVENÇÃO
DE
COMPARAÇÃO,
PLACEBO OU
NÃO-
INTERVENÇÃO
O

OUTCOME =
DESFECHO,
RESULTADO
ESPERADO:
EFETIVIDADE,
MORTALIDADE
ETC.
P


POPULAÇÃO,
PACIENTE
(IDADE, RAÇA,
SEXO, STATUS DE
SAÚDE) OU
PROBLEMA


I




INTERESSE
Co




CONTEXTO
PESQUISA NÃO-CLÍNICA
Saiba mais: www.slideshare.net/bibliotecaee/o-que-pico-e-pico.
Auxilia na construção de uma pergunta
de pesquisa básica, não clínica.

PICOTS: T=tempo; S=study design/tipos de estudos.

10. Sobre Revisão Sistemática
Curso Revisão Sistemática e Meta-análise
Curso gratuito online oferecido pela Unicamp via
Coursera. www.coursera.org/learn/revisao-sistematica
Fontes e estratégia de busca
Apresentação Biblioteca Famed-HCPA UFRGS:
www.ufrgs.br/bibmed/wp-content/
uploads/RevisaoSistematica-Parte1.pdf

11. Termos MeSH
Use o MeSH – Medical Subject Headings como ponto de
partida para definir os termos de busca na
PubMed/MEDLINE.
MeSH é o principal vocabulário em saúde. A partir dele,
adapte a estratégia para outras bases: Embase – Emtree,
BVS-LILACS – DeCS etc.
Adicione sinônimos, variações e termos livres na
estratégia. A busca na PubMed via MeSH não inclui essa
possibilidade.
O MeSH não mudou a partir da nova interface.

12. Novidades na busca da nova interface
Busca básica amplia a busca do termo digitado para
sinônimos, ampliando a sensibilidade.
Inclui variação de termos do inglês britânico e americano,
plural, sinônimos, variações etc.
A busca não é completa, de ‘alta sensibilidade’ para a
revisão sistemática, por exemplo, e deve ser revisada.
Contempla as possibilidades da máquina, mas é preciso
adicionar a sensibilidade humana, de especialistas.
Priorize a construção manual da estratégia de busca.

13. Outras dicas sobre estratégias de busca
Elabore estratégias de busca complexas em arquivos de
texto sem formatação (Wordpad, por ex.) e, após,
transponha a estratégia para o campo de busca da PubMed.
Elabore estratégias por blocos/conjuntos, teste os blocos
na busca básica e combine as estratégias na busca
avançada.
Registre as estratégias utilizadas. Avalie, adapte e melhore
as estratégias no decorrer do processo de pesquisa.
Salve Alertas para ser informado de novas publicações.

14. Acesso direto:
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
Acesso via
Portal de Periódicos da Capes:
www.periodicos.capes.gov.br

18. Busca básica

19. Busca avançada

20. Busca por autor

21. Estratégia de busca
POR BLOCOS/CONJUNTOS

#1
COVID-19 OR (2019 novel coronavirus disease) OR COVID19 OR (COVID-19 pandemic) OR
(SARS-CoV-2 infection) OR (COVID-19 virus disease) OR (2019 novel coronavirus infection) OR
(2019-nCoV infection) OR (coronavirus disease 2019) OR (coronavirus disease-19) OR (2019-nCoV
disease) OR (COVID-19 virus infection)

#2
Hydroxychloroquine OR Oxychlorochin OR Oxychloroquine OR Hydroxychlorochin OR Plaquenil
OR (Hydroxychloroquine Sulfate) OR (Hydroxychloroquine Sulfate (1:1) Salt)

#3
Chloroquine OR Chlorochin OR Chingamin OR Khingamin OR Nivaquine OR (Chloroquine Sulfate)
OR (Sulfate, Chloroquine) OR (Chloroquine Sulphate) OR (Sulphate, Chloroquine) OR Aralen OR
Arequin OR Arechine

#4
Azithromycin OR Azythromycin OR Sumamed OR Toraseptol OR Vinzam OR CP-62993 OR CP
62993 OR CP62993 OR Zithromax OR Azitrocin OR Azadose OR Ultreon OR Zitromax OR
(Azithromycin Dihydrate) OR (Dihydrate, Azithromycin) OR (Azithromycin Monohydrate) OR
(Monohydrate, Azithromycin) OR Goxal OR Zentavion
#1 AND (#2 OR #3 OR #4)

22. Estratégia de busca
COMPLETA

(((((((((((((((((("covid 19"[All Fields] OR "covid 2019"[All Fields]) OR "severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"[Supplementary Concept]) OR "severe acute respiratory
syndrome coronavirus 2"[All Fields]) OR "2019 ncov"[All Fields]) OR "sars cov 2"[All Fields]) OR "2019ncov"[All Fields]) OR (("wuhan"[All Fields] AND ("coronavirus"[MeSH
Terms] OR "coronavirus"[All Fields])) AND (2019/12/1:2019/12/31[Date - Publication] OR 2020/1/1:2020/12/31[Date - Publication]))) OR (("covid 19"[Supplementary Concept]
OR "covid 19"[All Fields]) OR "2019 novel coronavirus disease"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "covid19"[All Fields])) OR
(("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "covid 19 pandemic"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR
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Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "2019 novel coronavirus infection"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "2019 ncov
infection"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "coronavirus disease 2019"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept]
OR "covid 19"[All Fields]) OR "coronavirus disease 19"[All Fields])) OR (("covid 19"[Supplementary Concept] OR "covid 19"[All Fields]) OR "2019 ncov disease"[All Fields]))
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"hydroxychloroquine"[All Fields]) OR ("hydroxychloroquine"[MeSH Terms] OR "hydroxychloroquine"[All Fields])) OR (("hydroxychloroquine"[MeSH Terms] OR
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"hydroxychloroquine"[MeSH Terms]) OR "hydroxychloroquine"[All Fields]) OR ("hydroxychloroquine"[All Fields] AND "sulfate"[All Fields])) OR "hydroxychloroquine sulfate"[All
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Fields] AND "chloride"[All Fields])) OR "sodium chloride"[All Fields]) OR "salt"[All Fields]))) OR ((((((((((((((("chloroquin"[All Fields] OR "chloroquine"[MeSH Terms]) OR
"chloroquine"[All Fields]) OR "chloroquine s"[All Fields]) OR "chloroquines"[All Fields]) OR (("chloroquine"[MeSH Terms] OR "chloroquine"[All Fields]) OR "chlorochin"[All
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"khingamin"[All Fields])) OR (("chloroquine"[MeSH Terms] OR "chloroquine"[All Fields]) OR "nivaquine"[All Fields])) OR (((("chloroquine sulphate"[All Fields] OR
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((("chloroquine"[MeSH Terms] OR "chloroquine"[All Fields]) OR ("sulfate"[All Fields] AND "chloroquine"[All Fields])) OR "sulfate chloroquine"[All Fields])) OR (((("chloroquine
sulphate"[All Fields] OR "chloroquine"[MeSH Terms]) OR "chloroquine"[All Fields]) OR ("chloroquine"[All Fields] AND "sulfate"[All Fields])) OR "chloroquine sulfate"[All
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Terms] OR "chloroquine"[All Fields]) OR "arechine"[All Fields]))) OR ((((((((((((((((((((("azithromycin"[MeSH Terms] OR "azithromycin"[All Fields]) OR "azithromycine"[All Fields])
OR "azithromycin s"[All Fields]) OR (("azithromycin"[MeSH Terms] OR "azithromycin"[All Fields]) OR "azythromycin"[All Fields])) OR (("azithromycin"[MeSH Terms] OR
"azithromycin"[All Fields]) OR "sumamed"[All Fields])) OR ("azithromycin"[MeSH Terms] OR "azithromycin"[All Fields])) OR ("azithromycin"[MeSH Terms] OR
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Fields] AND "azithromycin"[All Fields]))) OR ("azithromycin"[MeSH Terms] OR "azithromycin"[All Fields])) OR ("azithromycin"[MeSH Terms] OR "azithromycin"[All Fields])))

27. Filtros de pesquisa PubMed
Filtros de pesquisa funcionam com base na indexação da
base de dados, ou seja, recuperam o que foi indexado como
tal. Pode haver alguma perda de conteúdos. Em revisões
sistemáticas, priorize aprimorar a estratégia de busca em
lugar de usar os filtros da base de dados.
Conteúdos MEDLINE: filtro Journal > MEDLINE.

28. Exportar referências para gerenciador:
Mendeley, Zotero, Endnote etc.

29. Atenção

O link para acesso ao texto
completo é ativado para
alguns editores e
conteúdos na PubMed.

Acesse o Portal de
Periódicos Capes para
certificar-se da
disponibilidade do texto
completo quando o link não
estiver ativo.

www.periodicos.capes.
gov.br
Exportar referência
Nova interface: artigos similares, que apareciam na página inicial de resultados, agora aparecem associados a
cada artigo. PubMed também passou a indicar os artigos citantes (Cited by).

30. ‘Create alert’
Salvar alerta para ser
informado sobre novas
publicações.

É preciso criar ou fazer
login para salvar.

31. Busca na PubMed com MeSH

32. PubMed Clinical Queries
Utilize para pesquisar estudos clínicos, revisões
sistemáticas e tópicos em Genética Médica.
Busca baseada em filtros de pesquisa, informados na base
de dados. Consulte os filtros e avalie o uso, pois pode haver
perda de conteúdos com a ferramenta de busca.
Clinical Queries não mudou a partir da nova interface da
PubMed.

35. Importar referências no Mendeley

36. Importar referências no Zotero

37. FAQs and PubMed User Guide
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/
Search Field Tags PubMed
https://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/020_710.html

Super 8
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Como referenciar:
UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL. Sistema de Bibliotecas.
Pesquisa com PubMed. 2020. 38 slides.